99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10910 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10910  transcriptional regulator  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  65.5 
 
 
1085 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  66.34 
 
 
1085 aa  245  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  61.84 
 
 
1137 aa  228  9e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11388  transcriptional regulator  50.61 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.865645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11390  transcriptional regulator  48.97 
 
 
250 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  37.56 
 
 
907 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  39.02 
 
 
982 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  32.39 
 
 
1392 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  36.63 
 
 
1141 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 
878 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6225  putative adenylate/guanylate cyclase  29.25 
 
 
532 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  34.42 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  34.06 
 
 
263 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  34.84 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  26.75 
 
 
2132 aa  63.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 
279 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  31.87 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  24.08 
 
 
1749 aa  60.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.75 
 
 
624 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  28.74 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.57 
 
 
664 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  32.12 
 
 
612 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 
667 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  28.03 
 
 
1344 aa  55.8  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
597 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  30.54 
 
 
462 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.76 
 
 
568 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  28.68 
 
 
320 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 
449 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 
449 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 
449 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  30.15 
 
 
306 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30 
 
 
588 aa  52.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40949  predicted protein  28.42 
 
 
214 aa  52.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  28.06 
 
 
304 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.63 
 
 
568 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  29.08 
 
 
553 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  30.71 
 
 
633 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  28.49 
 
 
471 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.23 
 
 
622 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  30.63 
 
 
594 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.23 
 
 
622 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  27.42 
 
 
431 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  35.59 
 
 
652 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.96 
 
 
648 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  31.45 
 
 
581 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.79 
 
 
738 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.88 
 
 
634 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  30.82 
 
 
647 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  29.57 
 
 
1139 aa  49.3  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11143  hypothetical protein  32.71 
 
 
164 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 
1138 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  28.1 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.35 
 
 
611 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  25.45 
 
 
680 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  28.07 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  27.03 
 
 
515 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  26.88 
 
 
441 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.65 
 
 
629 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.59 
 
 
595 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
626 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.67 
 
 
1094 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  33.1 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.59 
 
 
598 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  31.06 
 
 
425 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  29.37 
 
 
1142 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  25.95 
 
 
529 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  27.74 
 
 
304 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.71 
 
 
631 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
1151 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
1151 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  30.3 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
1148 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  23.46 
 
 
701 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.47 
 
 
596 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.88 
 
 
1149 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  28.1 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  26.32 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  26.19 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  23.46 
 
 
701 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  30.28 
 
 
645 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2195  adenylate/guanylate cyclase  25.32 
 
 
255 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11664  hypothetical protein  32.41 
 
 
316 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.77538 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.69 
 
 
643 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  29.93 
 
 
400 aa  43.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  25.33 
 
 
744 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  26.88 
 
 
701 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  28.65 
 
 
439 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  25.95 
 
 
312 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  27.33 
 
 
735 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.73 
 
 
1096 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  24.72 
 
 
665 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>