More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2078 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2078  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
940 aa  1801    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.9735  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  63.97 
 
 
951 aa  977    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  60.2 
 
 
931 aa  909    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  39.21 
 
 
919 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 
938 aa  313  7.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.68 
 
 
1085 aa  280  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3572  transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 
914 aa  276  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
1137 aa  258  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  41.03 
 
 
887 aa  240  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.7 
 
 
960 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  39.49 
 
 
882 aa  231  5e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  43.32 
 
 
1119 aa  228  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  40.31 
 
 
1087 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 
943 aa  225  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  36.8 
 
 
701 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  41 
 
 
1056 aa  223  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
1085 aa  223  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  43.32 
 
 
781 aa  222  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  41.3 
 
 
980 aa  221  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
775 aa  219  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  42.05 
 
 
969 aa  218  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  41.6 
 
 
824 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  37.35 
 
 
1092 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  44.99 
 
 
1093 aa  212  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  38.68 
 
 
1227 aa  211  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  41.38 
 
 
1110 aa  211  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  42.45 
 
 
755 aa  210  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  42.82 
 
 
1049 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  41.06 
 
 
1050 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.17 
 
 
1043 aa  208  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  38.38 
 
 
1125 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  40.86 
 
 
1055 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  39.8 
 
 
799 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.01 
 
 
816 aa  207  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  35.32 
 
 
928 aa  205  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 
1042 aa  204  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  40.16 
 
 
1058 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  32.95 
 
 
950 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
814 aa  202  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 
1066 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.35 
 
 
1102 aa  201  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  39.42 
 
 
658 aa  201  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  40.4 
 
 
1036 aa  201  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  40.4 
 
 
907 aa  201  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.47 
 
 
1100 aa  200  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.63 
 
 
1017 aa  200  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  41.22 
 
 
982 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  36.48 
 
 
999 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  38.36 
 
 
792 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
1082 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  36.19 
 
 
678 aa  199  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  34.81 
 
 
972 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  36.63 
 
 
973 aa  196  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  33.52 
 
 
966 aa  195  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 
878 aa  193  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  38.61 
 
 
886 aa  193  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  34.58 
 
 
776 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 
957 aa  191  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  40.93 
 
 
1072 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  37.97 
 
 
1001 aa  191  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  43.42 
 
 
840 aa  191  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  36.81 
 
 
777 aa  190  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  38.12 
 
 
765 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  32.75 
 
 
877 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  39.19 
 
 
1060 aa  188  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  41.19 
 
 
952 aa  187  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  36.81 
 
 
818 aa  187  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 
961 aa  187  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  31.14 
 
 
812 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.79 
 
 
1103 aa  187  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  40.06 
 
 
1064 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  38.95 
 
 
973 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  40.76 
 
 
948 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
393 aa  185  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  38.66 
 
 
973 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  36.33 
 
 
591 aa  184  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  37.43 
 
 
1141 aa  184  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  40.47 
 
 
948 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  30.96 
 
 
956 aa  184  9.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  35.37 
 
 
921 aa  184  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  38.42 
 
 
760 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  34.01 
 
 
1014 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  37.87 
 
 
1097 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  35.89 
 
 
1058 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  35.37 
 
 
601 aa  182  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  37 
 
 
954 aa  181  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  41.4 
 
 
1100 aa  181  8e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  40.84 
 
 
1158 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  37.43 
 
 
490 aa  179  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  35.37 
 
 
601 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  35.37 
 
 
601 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  35.38 
 
 
953 aa  178  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  36.86 
 
 
618 aa  178  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.78 
 
 
827 aa  177  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  35.97 
 
 
591 aa  177  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  29.16 
 
 
959 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  31.16 
 
 
831 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  36.1 
 
 
1076 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  35.66 
 
 
1010 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  36.18 
 
 
910 aa  174  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>