More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1685 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  50.26 
 
 		 963 aa  766    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  54.11 
 
 		 980 aa  793    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  48.89 
 
 		 941 aa  707    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 943 aa  1841    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  49 
 
 		 1141 aa  568  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  61.2 
 
 		 878 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.8 
 
 		 957 aa  356  8.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  36.78 
 
 		 960 aa  337  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  39.48 
 
 		 952 aa  325  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  38.3 
 
 		 969 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 		 1058 aa  320  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  37.74 
 
 		 1042 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  40.21 
 
 		 1056 aa  317  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.78 
 
 		 1102 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  40.16 
 
 		 1110 aa  314  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  36.65 
 
 		 1050 aa  313  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 1100 aa  313  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  38.82 
 
 		 1087 aa  311  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  37.55 
 
 		 1092 aa  308  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.51 
 
 		 1125 aa  302  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  37.75 
 
 		 1018 aa  301  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  36.88 
 
 		 1066 aa  301  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.43 
 
 		 1036 aa  294  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.52 
 
 		 1017 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  38.49 
 
 		 1055 aa  288  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 1043 aa  288  4e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  38.41 
 
 		 1093 aa  287  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  37.41 
 
 		 1058 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 1082 aa  284  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  37.66 
 
 		 1049 aa  281  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.83 
 
 		 1097 aa  278  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  35.92 
 
 		 1103 aa  275  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  39.72 
 
 		 1072 aa  273  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  36.74 
 
 		 1158 aa  267  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  38.83 
 
 		 922 aa  266  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  33.56 
 
 		 1064 aa  258  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 1094 aa  255  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  41.15 
 
 		 1085 aa  248  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 1137 aa  248  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 781 aa  247  9e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  35.85 
 
 		 1048 aa  240  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  36.48 
 
 		 1005 aa  239  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  33 
 
 		 943 aa  234  8.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  38.94 
 
 		 792 aa  234  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  36.03 
 
 		 1060 aa  233  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  42.82 
 
 		 755 aa  232  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  37.44 
 
 		 701 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  41.64 
 
 		 824 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 1085 aa  225  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 775 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  38.82 
 
 		 1028 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  43.13 
 
 		 916 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  40.25 
 
 		 886 aa  219  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  42.81 
 
 		 887 aa  219  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  31 
 
 		 999 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  43.63 
 
 		 840 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 882 aa  215  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  33.24 
 
 		 1131 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  40.61 
 
 		 972 aa  214  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.22 
 
 		 760 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  37.13 
 
 		 1005 aa  208  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  37.38 
 
 		 950 aa  208  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  36.92 
 
 		 776 aa  207  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  34.96 
 
 		 765 aa  207  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 1227 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  40.6 
 
 		 919 aa  206  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  33.77 
 
 		 1100 aa  204  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  42.65 
 
 		 951 aa  201  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 630 aa  201  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 831 aa  201  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  38.2 
 
 		 678 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  36.27 
 
 		 1049 aa  199  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  40.05 
 
 		 814 aa  199  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  39.14 
 
 		 799 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 931 aa  197  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  36.31 
 
 		 921 aa  197  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  38.08 
 
 		 961 aa  197  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 1186 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  34.45 
 
 		 816 aa  195  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  33.66 
 
 		 630 aa  194  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  40.64 
 
 		 948 aa  194  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  40.64 
 
 		 948 aa  193  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  38.9 
 
 		 393 aa  193  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  38.8 
 
 		 973 aa  193  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  31.83 
 
 		 888 aa  193  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 966 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  40.89 
 
 		 954 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  38.9 
 
 		 877 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 1161 aa  189  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  37.84 
 
 		 1119 aa  189  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  34.77 
 
 		 1079 aa  188  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 973 aa  187  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 973 aa  187  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 938 aa  185  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  37.8 
 
 		 780 aa  184  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  42.69 
 
 		 591 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 959 aa  183  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 953 aa  183  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  36.06 
 
 		 1076 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 618 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>