More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4666 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 1100 aa  2157    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  42.5 
 
 		 1087 aa  633  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 1093 aa  623  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  42.18 
 
 		 1056 aa  624  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  42.29 
 
 		 1072 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  41.19 
 
 		 1043 aa  606  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  51.69 
 
 		 1186 aa  599  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  40.05 
 
 		 1050 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  40.64 
 
 		 1066 aa  576  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  43.14 
 
 		 1058 aa  574  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  43.06 
 
 		 1110 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  40.51 
 
 		 1097 aa  568  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  37.85 
 
 		 1042 aa  561  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 1082 aa  548  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.6 
 
 		 1058 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  41.56 
 
 		 1036 aa  542  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 1049 aa  531  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.68 
 
 		 1125 aa  512  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  37.24 
 
 		 1092 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  38.53 
 
 		 1060 aa  497  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  40.31 
 
 		 1094 aa  486  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  38.41 
 
 		 1048 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.77 
 
 		 1102 aa  475  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  38.14 
 
 		 1103 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 1028 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  38.85 
 
 		 1005 aa  449  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.04 
 
 		 1055 aa  446  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.79 
 
 		 1017 aa  426  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  40.88 
 
 		 960 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  40.16 
 
 		 952 aa  395  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 969 aa  395  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.8 
 
 		 957 aa  389  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 1158 aa  364  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  32.89 
 
 		 1018 aa  357  8.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  35.8 
 
 		 922 aa  355  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  39.26 
 
 		 1005 aa  333  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 943 aa  327  7e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 781 aa  320  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  32.54 
 
 		 1131 aa  313  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 1227 aa  303  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.1 
 
 		 999 aa  300  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  34.19 
 
 		 1064 aa  288  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  35.69 
 
 		 941 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  37.32 
 
 		 816 aa  288  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  35.66 
 
 		 792 aa  283  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 963 aa  280  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  33.55 
 
 		 1049 aa  279  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  36.35 
 
 		 1085 aa  278  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  34.78 
 
 		 701 aa  276  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  36.35 
 
 		 980 aa  276  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  33.54 
 
 		 824 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 1034 aa  268  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  42.68 
 
 		 1119 aa  268  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 943 aa  266  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 814 aa  262  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 1137 aa  259  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  34.31 
 
 		 1076 aa  258  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  40.16 
 
 		 765 aa  257  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 775 aa  257  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  39.41 
 
 		 972 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 1085 aa  253  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  43.2 
 
 		 840 aa  250  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 1027 aa  249  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  36.64 
 
 		 886 aa  248  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  39.13 
 
 		 760 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  33.1 
 
 		 799 aa  241  8e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  36.46 
 
 		 921 aa  240  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  32.33 
 
 		 1060 aa  239  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  34.11 
 
 		 1100 aa  238  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  38.19 
 
 		 887 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 882 aa  234  8.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 950 aa  233  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  37.93 
 
 		 776 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 1079 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  38.25 
 
 		 916 aa  229  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  32.2 
 
 		 1056 aa  228  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  38.09 
 
 		 780 aa  226  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 1161 aa  225  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.57 
 
 		 901 aa  222  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  35.76 
 
 		 779 aa  221  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  36.65 
 
 		 678 aa  220  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  38.04 
 
 		 940 aa  219  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  35.8 
 
 		 818 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  33.67 
 
 		 630 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 877 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  33.07 
 
 		 888 aa  215  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  34.2 
 
 		 777 aa  214  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  40.31 
 
 		 1010 aa  213  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  37.2 
 
 		 966 aa  213  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 1064 aa  211  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 910 aa  211  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  32.87 
 
 		 630 aa  210  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 1001 aa  207  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 		 768 aa  206  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  40.55 
 
 		 591 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  38.76 
 
 		 961 aa  203  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33.02 
 
 		 990 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 591 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.65 
 
 		 1104 aa  203  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 812 aa  203  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>