282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1195 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  100 
 
 		 780 aa  1526    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  41.13 
 
 		 792 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  41.08 
 
 		 840 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  36.93 
 
 		 701 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 814 aa  359  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  37.48 
 
 		 775 aa  340  5e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.71 
 
 		 960 aa  324  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  36.4 
 
 		 678 aa  313  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  35.29 
 
 		 776 aa  303  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  31.58 
 
 		 777 aa  296  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  42.6 
 
 		 755 aa  283  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.95 
 
 		 999 aa  280  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  35.43 
 
 		 1085 aa  276  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.98 
 
 		 1092 aa  277  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  38.43 
 
 		 1119 aa  267  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.62 
 
 		 816 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  33.5 
 
 		 1049 aa  264  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.13 
 
 		 1125 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 1066 aa  258  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 781 aa  257  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  39.09 
 
 		 760 aa  256  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  33.47 
 
 		 824 aa  254  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 765 aa  249  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.12 
 
 		 1102 aa  248  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  41.43 
 
 		 1056 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  39.17 
 
 		 1103 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  41.14 
 
 		 886 aa  237  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  39.05 
 
 		 1050 aa  237  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  39.83 
 
 		 1017 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  40.23 
 
 		 1087 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  32.04 
 
 		 827 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 1082 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  35.14 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 882 aa  231  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 1058 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  33.23 
 
 		 644 aa  231  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 957 aa  230  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 1137 aa  229  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  38.3 
 
 		 1100 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  35.78 
 
 		 1042 aa  225  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  43.85 
 
 		 969 aa  224  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 928 aa  223  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  36.94 
 
 		 916 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  32.07 
 
 		 768 aa  223  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 901 aa  223  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  40.6 
 
 		 1055 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 952 aa  221  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 1043 aa  220  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  30.86 
 
 		 1097 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.76 
 
 		 1227 aa  219  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  39.59 
 
 		 887 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 1058 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  38.46 
 
 		 1036 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  38.73 
 
 		 1005 aa  214  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 818 aa  211  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 973 aa  210  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.9 
 
 		 1110 aa  210  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  30.4 
 
 		 888 aa  210  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  37.42 
 
 		 1060 aa  210  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  31.57 
 
 		 910 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  35.95 
 
 		 966 aa  209  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 1085 aa  207  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  36.19 
 
 		 921 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  36.19 
 
 		 950 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1065  ATPase-like protein  31.26 
 
 		 649 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.444255  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 1093 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 972 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 		 736 aa  198  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 393 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 877 aa  197  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  37.88 
 
 		 1072 aa  197  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  32.16 
 
 		 1010 aa  196  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  27.48 
 
 		 975 aa  195  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  40.96 
 
 		 1094 aa  194  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 1001 aa  193  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 798 aa  193  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  35.7 
 
 		 961 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37.8 
 
 		 943 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  35.81 
 
 		 950 aa  191  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  34.86 
 
 		 1076 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 1049 aa  191  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  35.98 
 
 		 959 aa  190  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  39.25 
 
 		 1158 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 799 aa  188  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  33.49 
 
 		 779 aa  187  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  32.57 
 
 		 797 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  33.25 
 
 		 591 aa  184  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  40.77 
 
 		 418 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 490 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  31.72 
 
 		 906 aa  181  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 1161 aa  180  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  30.51 
 
 		 1018 aa  180  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 973 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 948 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 591 aa  179  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  36.08 
 
 		 1064 aa  179  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  35.28 
 
 		 953 aa  178  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  37.05 
 
 		 1079 aa  178  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 1005 aa  177  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  36.16 
 
 		 931 aa  177  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>