More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10391 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  59.91 
 
 		 1085 aa  1181    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 1085 aa  2160    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 882 aa  857    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  52.97 
 
 		 887 aa  751    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  56.53 
 
 		 1137 aa  1078    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 781 aa  335  4e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  49.86 
 
 		 393 aa  329  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  36.65 
 
 		 824 aa  320  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  34.17 
 
 		 1125 aa  319  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  36.7 
 
 		 907 aa  316  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  36.96 
 
 		 792 aa  303  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  41.12 
 
 		 701 aa  301  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  38.1 
 
 		 999 aa  300  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  36.42 
 
 		 1119 aa  296  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  35.05 
 
 		 1087 aa  295  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  38.64 
 
 		 765 aa  295  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  37.13 
 
 		 886 aa  292  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  35.08 
 
 		 982 aa  290  9e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 1227 aa  289  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.1 
 
 		 816 aa  277  7e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 		 1141 aa  275  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.4 
 
 		 960 aa  273  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 775 aa  274  9e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  32.44 
 
 		 1092 aa  271  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  33.87 
 
 		 799 aa  270  8.999999999999999e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  34.47 
 
 		 1102 aa  270  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.96 
 
 		 969 aa  265  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  35.58 
 
 		 1017 aa  263  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  38.08 
 
 		 950 aa  261  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  39.26 
 
 		 878 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  41.82 
 
 		 840 aa  261  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 901 aa  257  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 1103 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10910  transcriptional regulator  66.34 
 
 		 285 aa  257  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  32.41 
 
 		 1050 aa  257  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  37.31 
 
 		 957 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  33.96 
 
 		 1049 aa  255  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  40.3 
 
 		 921 aa  253  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  42.13 
 
 		 1056 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 1100 aa  253  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  39.16 
 
 		 678 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 1097 aa  248  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 814 aa  247  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.12 
 
 		 952 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  32.82 
 
 		 1055 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.71 
 
 		 760 aa  241  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 1043 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  34.35 
 
 		 1072 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  40.19 
 
 		 1042 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  36.98 
 
 		 776 aa  239  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 1058 aa  237  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  38.27 
 
 		 1058 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  40.39 
 
 		 755 aa  234  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 972 aa  234  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  30.38 
 
 		 975 aa  232  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 		 726 aa  231  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 768 aa  231  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.16 
 
 		 877 aa  231  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  38.44 
 
 		 916 aa  229  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 1082 aa  228  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 818 aa  227  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 973 aa  225  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  37.67 
 
 		 1001 aa  224  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 1094 aa  224  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  39.02 
 
 		 1060 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  41.26 
 
 		 931 aa  221  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  44.02 
 
 		 951 aa  220  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 1010 aa  220  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  40.61 
 
 		 1110 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  41.06 
 
 		 943 aa  219  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  40 
 
 		 948 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 601 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 1093 aa  219  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  39.48 
 
 		 973 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  44.38 
 
 		 919 aa  218  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  37.41 
 
 		 1076 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 601 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  34.98 
 
 		 1036 aa  215  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 601 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 658 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  28.33 
 
 		 956 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  31.82 
 
 		 827 aa  214  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  40.73 
 
 		 591 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 1014 aa  213  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 948 aa  213  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 591 aa  213  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  35.95 
 
 		 966 aa  213  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 910 aa  212  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  36.87 
 
 		 618 aa  211  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 736 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 928 aa  205  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  34.47 
 
 		 1064 aa  204  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 888 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  37.27 
 
 		 1131 aa  202  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  41.09 
 
 		 1158 aa  202  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  34.53 
 
 		 961 aa  201  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  35.89 
 
 		 922 aa  201  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  37.12 
 
 		 780 aa  201  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 872 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11388  transcriptional regulator  54.23 
 
 		 299 aa  197  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.865645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>