More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6897 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  55.88 
 
 		 1055 aa  937    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  48.51 
 
 		 1158 aa  791    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  55.42 
 
 		 1017 aa  959    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  55.67 
 
 		 1102 aa  1006    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  60.29 
 
 		 1092 aa  1129    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  100 
 
 		 1125 aa  2155    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  62.97 
 
 		 1103 aa  1198    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  51.28 
 
 		 1227 aa  618  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  40.2 
 
 		 1056 aa  522  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  38.43 
 
 		 1050 aa  519  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  39.06 
 
 		 1087 aa  502  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 		 1100 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 1042 aa  489  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  40.22 
 
 		 1058 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.87 
 
 		 1110 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.9 
 
 		 1097 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.49 
 
 		 1043 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  36.35 
 
 		 1049 aa  446  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  42.7 
 
 		 1066 aa  442  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  35.78 
 
 		 1058 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  40.89 
 
 		 1072 aa  439  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.73 
 
 		 1036 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  40.46 
 
 		 960 aa  428  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  37.29 
 
 		 1048 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  41.43 
 
 		 957 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  36.3 
 
 		 1093 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  35.92 
 
 		 1060 aa  400  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 1082 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  34.04 
 
 		 1018 aa  386  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.77 
 
 		 969 aa  365  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 1094 aa  363  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  40.4 
 
 		 1005 aa  362  3e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 1028 aa  356  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  36.63 
 
 		 922 aa  344  7e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  34.16 
 
 		 1085 aa  325  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.15 
 
 		 999 aa  326  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  37.92 
 
 		 792 aa  326  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  39.03 
 
 		 1005 aa  318  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  35.45 
 
 		 824 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  36.64 
 
 		 943 aa  301  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  40.11 
 
 		 886 aa  301  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 775 aa  301  6e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 781 aa  298  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 1137 aa  290  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  36.57 
 
 		 818 aa  289  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 1085 aa  289  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  36.14 
 
 		 1119 aa  284  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  36.93 
 
 		 799 aa  279  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.57 
 
 		 816 aa  275  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  38.97 
 
 		 701 aa  275  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 901 aa  275  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 882 aa  269  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 1186 aa  266  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 963 aa  265  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  33.74 
 
 		 1064 aa  263  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  33.41 
 
 		 887 aa  263  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  37.28 
 
 		 980 aa  262  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  43.66 
 
 		 972 aa  259  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  43.77 
 
 		 916 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 814 aa  258  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 943 aa  255  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 765 aa  255  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  36.15 
 
 		 755 aa  254  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  34.66 
 
 		 776 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  34.16 
 
 		 1131 aa  248  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  38.09 
 
 		 1076 aa  248  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 1034 aa  247  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.41 
 
 		 827 aa  245  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  35.77 
 
 		 1049 aa  245  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  41.5 
 
 		 840 aa  244  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  34.64 
 
 		 941 aa  244  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  37.71 
 
 		 760 aa  242  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  40.31 
 
 		 780 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 		 1100 aa  234  8.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  39.35 
 
 		 678 aa  234  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  35.84 
 
 		 928 aa  233  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  35.02 
 
 		 1161 aa  229  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  31.89 
 
 		 1056 aa  229  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 799 aa  228  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 1001 aa  227  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 1010 aa  226  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  38.85 
 
 		 921 aa  225  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  41.56 
 
 		 591 aa  225  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  40.05 
 
 		 591 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  37.92 
 
 		 779 aa  224  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  33.76 
 
 		 1079 aa  223  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  32.05 
 
 		 840 aa  221  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  40.78 
 
 		 601 aa  221  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  37.7 
 
 		 1060 aa  221  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 950 aa  221  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 910 aa  221  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.44 
 
 		 966 aa  220  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  38.25 
 
 		 877 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  40.25 
 
 		 973 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 736 aa  218  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 973 aa  218  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  33.44 
 
 		 630 aa  218  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  41 
 
 		 601 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  41.32 
 
 		 948 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  41 
 
 		 601 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>