More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35430 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  45.88 
 
 		 1028 aa  651    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  45.51 
 
 		 1058 aa  762    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  100 
 
 		 1060 aa  2058    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  46.1 
 
 		 1048 aa  727    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  40.64 
 
 		 1056 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  38.2 
 
 		 1100 aa  535  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  39.4 
 
 		 1093 aa  534  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  39.33 
 
 		 1050 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 1082 aa  515  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  42.75 
 
 		 1087 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  41.4 
 
 		 1066 aa  507  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  38.51 
 
 		 1042 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  37.85 
 
 		 1097 aa  506  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  38.31 
 
 		 1043 aa  498  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  43.33 
 
 		 1072 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  41.51 
 
 		 1049 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 1058 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  40.56 
 
 		 1110 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.48 
 
 		 1125 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  39.59 
 
 		 1036 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  37.59 
 
 		 1092 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.57 
 
 		 1102 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.87 
 
 		 1103 aa  438  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  38.03 
 
 		 1055 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  40.3 
 
 		 1094 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 1005 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  35.31 
 
 		 1017 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  41.72 
 
 		 957 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  40.32 
 
 		 960 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  38.88 
 
 		 952 aa  357  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  36.52 
 
 		 922 aa  346  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  38.23 
 
 		 1158 aa  341  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  37.92 
 
 		 1018 aa  323  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.64 
 
 		 969 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  35.63 
 
 		 1227 aa  302  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  36.21 
 
 		 824 aa  299  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  41.46 
 
 		 1085 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 1186 aa  284  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  37.02 
 
 		 701 aa  281  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 1005 aa  278  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.86 
 
 		 999 aa  275  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  37 
 
 		 886 aa  273  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  36.24 
 
 		 943 aa  272  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  34.8 
 
 		 1131 aa  264  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  31.3 
 
 		 1064 aa  264  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 781 aa  261  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 1034 aa  257  8e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  39.9 
 
 		 792 aa  252  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 775 aa  248  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 1137 aa  248  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  41.45 
 
 		 840 aa  243  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  42.28 
 
 		 1119 aa  242  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  36.01 
 
 		 980 aa  242  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  37.52 
 
 		 941 aa  241  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  43.41 
 
 		 887 aa  241  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  36.73 
 
 		 799 aa  241  6.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 963 aa  239  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  34.56 
 
 		 1076 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  38.78 
 
 		 776 aa  239  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  43.09 
 
 		 973 aa  237  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  38.19 
 
 		 921 aa  237  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  42.82 
 
 		 973 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  41.95 
 
 		 1010 aa  235  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 818 aa  233  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  33.71 
 
 		 943 aa  233  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 1085 aa  233  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  28.91 
 
 		 816 aa  230  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  40.4 
 
 		 755 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 948 aa  230  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 973 aa  230  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  37.44 
 
 		 760 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 882 aa  229  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  35.92 
 
 		 1060 aa  229  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  41.49 
 
 		 948 aa  228  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  35.54 
 
 		 1161 aa  226  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.96 
 
 		 916 aa  224  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  35.1 
 
 		 777 aa  224  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  35.03 
 
 		 1100 aa  223  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  39.42 
 
 		 877 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  41.6 
 
 		 658 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  37.01 
 
 		 950 aa  221  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  41.16 
 
 		 1001 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 922 aa  218  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 814 aa  217  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 765 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  40.47 
 
 		 591 aa  214  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  40.71 
 
 		 827 aa  210  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 1049 aa  209  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  39.43 
 
 		 601 aa  208  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 591 aa  208  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  38.4 
 
 		 966 aa  207  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  37.22 
 
 		 780 aa  206  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 1079 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 393 aa  202  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  37.03 
 
 		 490 aa  201  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 972 aa  201  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  39.67 
 
 		 601 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  39.67 
 
 		 601 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  40.21 
 
 		 1141 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  38.32 
 
 		 953 aa  199  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>