More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3528 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 1005 aa  1915    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.77 
 
 		 1103 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.78 
 
 		 1125 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.04 
 
 		 1092 aa  383  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  40.35 
 
 		 1110 aa  366  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.76 
 
 		 1102 aa  360  7e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  39.63 
 
 		 1043 aa  342  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  39.7 
 
 		 1100 aa  341  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  38.12 
 
 		 1056 aa  340  8e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 957 aa  340  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  37.68 
 
 		 1087 aa  339  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  40 
 
 		 1017 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 1097 aa  333  7.000000000000001e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  40.99 
 
 		 1036 aa  330  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  41.12 
 
 		 1072 aa  328  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  37.35 
 
 		 1050 aa  324  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  38.45 
 
 		 1066 aa  323  8e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.93 
 
 		 960 aa  318  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  35.49 
 
 		 1042 aa  317  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.24 
 
 		 1055 aa  313  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  40.75 
 
 		 969 aa  310  9e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  40.42 
 
 		 1158 aa  310  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  35.1 
 
 		 1058 aa  310  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  38.97 
 
 		 1058 aa  309  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 1049 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37.82 
 
 		 952 aa  303  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.98 
 
 		 816 aa  291  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.62 
 
 		 999 aa  278  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  37.43 
 
 		 1093 aa  265  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.07 
 
 		 943 aa  262  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  38.59 
 
 		 1048 aa  261  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  38.76 
 
 		 1028 aa  257  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  38.24 
 
 		 922 aa  256  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  36.19 
 
 		 943 aa  257  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  37.76 
 
 		 1060 aa  256  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 781 aa  254  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  36.64 
 
 		 1085 aa  254  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  41.65 
 
 		 916 aa  249  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  34.87 
 
 		 1018 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  41.7 
 
 		 886 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 882 aa  244  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 1227 aa  241  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 1137 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  43.63 
 
 		 1119 aa  234  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  42.15 
 
 		 887 aa  232  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 901 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  34.98 
 
 		 768 aa  226  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  38.34 
 
 		 1094 aa  225  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  36.1 
 
 		 963 aa  225  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  42.92 
 
 		 840 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 736 aa  224  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  34.97 
 
 		 824 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  35.42 
 
 		 792 aa  223  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 726 aa  223  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 775 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 799 aa  222  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  30.35 
 
 		 975 aa  219  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  39.81 
 
 		 780 aa  218  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  35.14 
 
 		 1131 aa  217  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 1082 aa  217  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.38 
 
 		 981 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  35.27 
 
 		 799 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  32.74 
 
 		 1064 aa  214  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  40.48 
 
 		 1186 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  40.92 
 
 		 755 aa  213  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 872 aa  213  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 980 aa  212  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  33.54 
 
 		 1056 aa  211  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 966 aa  210  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  28.62 
 
 		 996 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  29.31 
 
 		 701 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 393 aa  206  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 888 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  33.19 
 
 		 941 aa  204  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 877 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  43 
 
 		 601 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 1085 aa  202  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 814 aa  201  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  41.61 
 
 		 601 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  41.61 
 
 		 601 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  33.55 
 
 		 964 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 798 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  35.7 
 
 		 779 aa  199  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 591 aa  199  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  35.01 
 
 		 1049 aa  197  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  33.17 
 
 		 797 aa  197  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  39.5 
 
 		 948 aa  195  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  35.86 
 
 		 950 aa  193  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  37.19 
 
 		 934 aa  193  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 910 aa  193  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  33.72 
 
 		 992 aa  193  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 831 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  42.94 
 
 		 1123 aa  192  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 591 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  38.68 
 
 		 940 aa  191  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 948 aa  191  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  39.53 
 
 		 921 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  33.28 
 
 		 630 aa  189  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 1005 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  32.16 
 
 		 765 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>