More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3338 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 919 aa  1795    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3572  transcriptional regulator, LuxR family  47.16 
 
 		 914 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  41.01 
 
 		 938 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  39.39 
 
 		 951 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2078  transcriptional regulator, LuxR family  39.04 
 
 		 940 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.9735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  38 
 
 		 931 aa  360  9e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  42.04 
 
 		 1085 aa  274  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  47.04 
 
 		 887 aa  250  9e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 882 aa  247  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  40.64 
 
 		 1119 aa  244  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 781 aa  233  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  44.7 
 
 		 1056 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  44.22 
 
 		 877 aa  231  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  39.58 
 
 		 1087 aa  230  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  42.43 
 
 		 960 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 1137 aa  228  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  43.21 
 
 		 1066 aa  228  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 957 aa  224  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  37.87 
 
 		 824 aa  221  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 1085 aa  218  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 393 aa  218  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  39.43 
 
 		 1092 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 952 aa  211  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  43.37 
 
 		 755 aa  211  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.53 
 
 		 1058 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 775 aa  208  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 1042 aa  208  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  40.33 
 
 		 1227 aa  205  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  43.52 
 
 		 1110 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  40.87 
 
 		 792 aa  205  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  43.19 
 
 		 1141 aa  204  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  38.38 
 
 		 1125 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 943 aa  204  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 1049 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  39.59 
 
 		 972 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  37.61 
 
 		 1050 aa  202  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 1058 aa  202  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  39.91 
 
 		 591 aa  202  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  37.78 
 
 		 701 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 1100 aa  201  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.68 
 
 		 969 aa  201  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  41.69 
 
 		 1097 aa  201  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  40.56 
 
 		 591 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  40.69 
 
 		 1017 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  45.4 
 
 		 601 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  37.47 
 
 		 950 aa  199  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  41.43 
 
 		 1072 aa  198  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  38.62 
 
 		 776 aa  197  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.28 
 
 		 1102 aa  196  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  38.79 
 
 		 999 aa  196  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 980 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  41.49 
 
 		 1036 aa  194  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  39.63 
 
 		 1055 aa  194  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 928 aa  194  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  45.4 
 
 		 601 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  45.4 
 
 		 601 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  38.87 
 
 		 956 aa  193  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  38.43 
 
 		 1060 aa  192  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.11 
 
 		 1103 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 		 921 aa  191  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  33.26 
 
 		 816 aa  191  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  40.73 
 
 		 840 aa  191  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  40.17 
 
 		 886 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  41.53 
 
 		 765 aa  189  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  41.29 
 
 		 1010 aa  187  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  37.39 
 
 		 760 aa  187  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  40.56 
 
 		 1001 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  42.61 
 
 		 941 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  33.57 
 
 		 888 aa  185  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 878 aa  184  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  40.83 
 
 		 658 aa  183  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  39.07 
 
 		 966 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  39.27 
 
 		 961 aa  181  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 1043 aa  181  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  37.24 
 
 		 827 aa  180  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 814 aa  179  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  40.24 
 
 		 1094 aa  179  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 768 aa  179  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  39.78 
 
 		 973 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  37.76 
 
 		 678 aa  178  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  38.92 
 
 		 907 aa  177  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  39.43 
 
 		 973 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  40.71 
 
 		 963 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 818 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  38.92 
 
 		 799 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 779 aa  173  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  38.24 
 
 		 1076 aa  172  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  38.48 
 
 		 982 aa  172  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  45.37 
 
 		 418 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  39.53 
 
 		 1100 aa  171  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  40.27 
 
 		 954 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 1014 aa  171  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  37.6 
 
 		 973 aa  169  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 1082 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  39.26 
 
 		 948 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  37.82 
 
 		 1064 aa  167  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  35.2 
 
 		 777 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  41.94 
 
 		 922 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  41.55 
 
 		 1018 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  40.88 
 
 		 1049 aa  166  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>