More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0829 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  60.32 
 
 		 1125 aa  1144    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  55.2 
 
 		 1102 aa  974    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  100 
 
 		 1092 aa  2096    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  50.37 
 
 		 1017 aa  835    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  58.2 
 
 		 1103 aa  1026    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  52.73 
 
 		 1055 aa  863    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  56.98 
 
 		 1158 aa  625  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  47.89 
 
 		 1227 aa  568  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  39.28 
 
 		 1050 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  40.36 
 
 		 1056 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  39.33 
 
 		 1087 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 1100 aa  485  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  41.06 
 
 		 1042 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  45.03 
 
 		 1058 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.4 
 
 		 1097 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  37.17 
 
 		 1110 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.73 
 
 		 1036 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 957 aa  439  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  38.32 
 
 		 1066 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.61 
 
 		 1058 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  35.83 
 
 		 1048 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  41.63 
 
 		 960 aa  403  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  36.92 
 
 		 1093 aa  402  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  38.47 
 
 		 1043 aa  402  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 1049 aa  392  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  37.7 
 
 		 1060 aa  392  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 952 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 969 aa  379  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  34.9 
 
 		 1018 aa  375  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.47 
 
 		 999 aa  369  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 1082 aa  370  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 1094 aa  363  9e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  38.54 
 
 		 1005 aa  357  8.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  36.78 
 
 		 1028 aa  351  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 922 aa  350  9e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 781 aa  320  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  36.87 
 
 		 824 aa  312  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.66 
 
 		 1085 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  36.35 
 
 		 792 aa  308  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  32.79 
 
 		 1064 aa  308  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37.55 
 
 		 943 aa  307  7e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  39.88 
 
 		 1005 aa  305  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 1137 aa  289  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  37.97 
 
 		 886 aa  288  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 775 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  35.72 
 
 		 818 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  36.66 
 
 		 882 aa  283  9e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  35.08 
 
 		 799 aa  282  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 980 aa  278  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 816 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  35.86 
 
 		 972 aa  272  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  38.81 
 
 		 1119 aa  271  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  34.63 
 
 		 943 aa  267  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 1186 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  37.62 
 
 		 1100 aa  265  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 901 aa  265  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  36.05 
 
 		 1131 aa  263  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  36.19 
 
 		 776 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  40.4 
 
 		 760 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 814 aa  262  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 765 aa  262  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  36.98 
 
 		 780 aa  261  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  39.43 
 
 		 1049 aa  259  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  36.65 
 
 		 963 aa  259  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  37.23 
 
 		 701 aa  258  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  36.24 
 
 		 1079 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  36.34 
 
 		 941 aa  257  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 887 aa  253  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 1027 aa  253  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 1085 aa  253  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  40.25 
 
 		 966 aa  253  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  36.08 
 
 		 840 aa  250  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 1161 aa  249  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  38.02 
 
 		 916 aa  245  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  38.35 
 
 		 1076 aa  244  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 1034 aa  244  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  41.84 
 
 		 1010 aa  241  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  39.8 
 
 		 1060 aa  239  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  41.56 
 
 		 877 aa  238  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  38.81 
 
 		 827 aa  237  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  41.44 
 
 		 973 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  38.83 
 
 		 921 aa  235  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  39.91 
 
 		 678 aa  233  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 799 aa  234  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  40.88 
 
 		 973 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  41.85 
 
 		 948 aa  233  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  41.25 
 
 		 948 aa  233  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  34.87 
 
 		 768 aa  231  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  40 
 
 		 591 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 831 aa  229  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 950 aa  228  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  40.87 
 
 		 1001 aa  227  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 736 aa  227  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  41.97 
 
 		 601 aa  224  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 888 aa  222  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  29 
 
 		 777 aa  221  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  28.33 
 
 		 975 aa  221  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  35.12 
 
 		 996 aa  221  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 973 aa  221  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 591 aa  220  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>