More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3308 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  59.21 
 
 		 1082 aa  942    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 1005 aa  1816    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 1093 aa  495  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 1100 aa  472  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 1049 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 1042 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  47.3 
 
 		 1056 aa  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  45.36 
 
 		 1058 aa  425  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  38.73 
 
 		 1060 aa  415  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  37.53 
 
 		 1087 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 1066 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 1058 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  45.35 
 
 		 1072 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.85 
 
 		 1097 aa  402  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  37.15 
 
 		 1050 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.78 
 
 		 1110 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.99 
 
 		 1043 aa  386  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  38.29 
 
 		 1048 aa  376  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  40.23 
 
 		 1028 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  39.29 
 
 		 1125 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  41.99 
 
 		 1102 aa  365  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  44.43 
 
 		 1036 aa  362  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  40.37 
 
 		 1092 aa  357  5.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  36.81 
 
 		 1094 aa  348  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  42.92 
 
 		 1017 aa  347  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  41.98 
 
 		 1055 aa  332  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.47 
 
 		 1103 aa  307  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.13 
 
 		 960 aa  304  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  37.66 
 
 		 1158 aa  303  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  41.77 
 
 		 922 aa  301  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  39.31 
 
 		 969 aa  298  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 957 aa  295  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  34.25 
 
 		 1018 aa  291  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  37.59 
 
 		 1064 aa  286  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.01 
 
 		 952 aa  273  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 		 1186 aa  271  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 		 943 aa  269  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 1227 aa  268  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  34.47 
 
 		 1131 aa  266  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  41.3 
 
 		 840 aa  265  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  39.48 
 
 		 792 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  38.31 
 
 		 1076 aa  252  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 775 aa  250  9e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 1085 aa  249  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 781 aa  247  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  38.11 
 
 		 1049 aa  246  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 886 aa  238  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  37.64 
 
 		 1100 aa  239  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 1137 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  37.3 
 
 		 980 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.58 
 
 		 943 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  37.17 
 
 		 701 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.23 
 
 		 999 aa  235  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  41.74 
 
 		 1119 aa  232  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  38.01 
 
 		 1161 aa  231  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  40.27 
 
 		 916 aa  231  6e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 1085 aa  229  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  35.39 
 
 		 799 aa  229  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  39.38 
 
 		 1079 aa  228  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 1005 aa  228  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  36.06 
 
 		 824 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  43.6 
 
 		 755 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 		 816 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  38.88 
 
 		 779 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 963 aa  214  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  38.9 
 
 		 887 aa  213  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 941 aa  214  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.59 
 
 		 760 aa  213  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  40.18 
 
 		 780 aa  208  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 1034 aa  208  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 1060 aa  208  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 814 aa  206  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  35.63 
 
 		 921 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  36.24 
 
 		 827 aa  204  9e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  38.5 
 
 		 776 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  38.48 
 
 		 950 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 882 aa  201  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 901 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  44.35 
 
 		 765 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  34.51 
 
 		 777 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  38.53 
 
 		 678 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 972 aa  190  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  32.64 
 
 		 928 aa  187  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  37.75 
 
 		 973 aa  187  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  38.58 
 
 		 953 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  35.37 
 
 		 818 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  40.05 
 
 		 1001 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  42.52 
 
 		 931 aa  184  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  38.52 
 
 		 948 aa  184  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 1010 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  38.42 
 
 		 973 aa  183  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 812 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  41.13 
 
 		 951 aa  183  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  41.28 
 
 		 919 aa  181  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  38.79 
 
 		 948 aa  181  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  29.42 
 
 		 888 aa  181  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  37.83 
 
 		 973 aa  181  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  38.4 
 
 		 877 aa  181  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  38.9 
 
 		 1141 aa  181  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  33.58 
 
 		 996 aa  180  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>