More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1350 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 1100 aa  2053    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  36.64 
 
 		 1131 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  37.14 
 
 		 1064 aa  396  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  34.99 
 
 		 1076 aa  327  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  36.78 
 
 		 1049 aa  323  7e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 1034 aa  314  6.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  37.79 
 
 		 1079 aa  299  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 1060 aa  294  7e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  39.84 
 
 		 1055 aa  291  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.68 
 
 		 1092 aa  283  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  38.58 
 
 		 1066 aa  281  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  43.11 
 
 		 1161 aa  275  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  36.2 
 
 		 1050 aa  271  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 1093 aa  270  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.43 
 
 		 1017 aa  267  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  32.33 
 
 		 1042 aa  265  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  36.88 
 
 		 1058 aa  264  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  36.55 
 
 		 1058 aa  261  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  35.74 
 
 		 1097 aa  261  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  33.26 
 
 		 1049 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  34.42 
 
 		 1043 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  37.85 
 
 		 1110 aa  256  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  34.78 
 
 		 1125 aa  255  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 1082 aa  253  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  34.36 
 
 		 1100 aa  250  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.83 
 
 		 1102 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  39.76 
 
 		 922 aa  243  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  36.01 
 
 		 1087 aa  242  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  36.16 
 
 		 1072 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.45 
 
 		 1036 aa  239  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  35.79 
 
 		 1018 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  35.41 
 
 		 1056 aa  231  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  35.17 
 
 		 1103 aa  231  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  35.2 
 
 		 969 aa  228  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  34.33 
 
 		 943 aa  227  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  36.22 
 
 		 960 aa  227  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  35.47 
 
 		 1158 aa  225  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 957 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  36.05 
 
 		 1005 aa  219  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  36.94 
 
 		 1048 aa  214  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  38.43 
 
 		 1094 aa  213  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  35.91 
 
 		 952 aa  207  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  35.66 
 
 		 1060 aa  207  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 1137 aa  204  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.03 
 
 		 999 aa  204  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  40.63 
 
 		 775 aa  204  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  36.88 
 
 		 1028 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  39.16 
 
 		 887 aa  198  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  39.52 
 
 		 1141 aa  197  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.44 
 
 		 1085 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 963 aa  192  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  39.12 
 
 		 755 aa  190  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  36.2 
 
 		 701 aa  189  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 882 aa  188  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 781 aa  187  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 948 aa  187  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 973 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  40.63 
 
 		 948 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  38.89 
 
 		 840 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.02 
 
 		 816 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  39.37 
 
 		 973 aa  186  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 886 aa  186  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  35.42 
 
 		 792 aa  184  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  32.21 
 
 		 941 aa  181  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 814 aa  180  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 1085 aa  180  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 765 aa  180  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 980 aa  180  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 1227 aa  180  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  37.36 
 
 		 827 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 973 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 878 aa  176  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 1010 aa  175  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 877 aa  173  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 931 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  39.01 
 
 		 919 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  38.08 
 
 		 824 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  34.03 
 
 		 777 aa  173  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  38.87 
 
 		 658 aa  173  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.74 
 
 		 916 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  33.41 
 
 		 921 aa  171  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 1001 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 630 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 601 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 966 aa  164  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  32.5 
 
 		 630 aa  164  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  32.88 
 
 		 780 aa  163  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  35.7 
 
 		 972 aa  162  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 591 aa  160  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  37.53 
 
 		 591 aa  159  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  37.4 
 
 		 678 aa  158  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 601 aa  158  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 601 aa  158  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 393 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 1186 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  36.69 
 
 		 618 aa  155  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  36.64 
 
 		 1119 aa  155  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  38.79 
 
 		 951 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  33.06 
 
 		 950 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  35.22 
 
 		 1014 aa  154  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>