More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1621 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  100 
 
 		 1064 aa  2081    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  35.42 
 
 		 1131 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  43.85 
 
 		 1100 aa  336  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  33.45 
 
 		 1049 aa  315  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 1079 aa  308  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 1161 aa  308  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  32.79 
 
 		 1092 aa  302  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  36.99 
 
 		 1042 aa  300  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 1060 aa  300  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  32.05 
 
 		 1050 aa  298  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 1034 aa  293  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  39.94 
 
 		 1093 aa  291  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  33.49 
 
 		 1066 aa  290  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  36.14 
 
 		 1058 aa  287  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  32.73 
 
 		 1049 aa  287  9e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.98 
 
 		 1017 aa  283  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  35.22 
 
 		 1056 aa  279  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  35.52 
 
 		 1097 aa  278  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  39.61 
 
 		 1055 aa  277  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  36.67 
 
 		 1072 aa  275  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  35.99 
 
 		 1087 aa  272  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  37.1 
 
 		 1110 aa  271  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  34.73 
 
 		 1100 aa  270  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  33.74 
 
 		 1125 aa  260  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 1043 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  33.56 
 
 		 943 aa  254  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  35.08 
 
 		 1036 aa  251  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.62 
 
 		 1102 aa  249  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  30.22 
 
 		 1058 aa  247  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 1082 aa  240  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 969 aa  239  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  32.83 
 
 		 1103 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 1005 aa  231  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  35.82 
 
 		 1094 aa  229  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  36.74 
 
 		 1018 aa  227  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 957 aa  226  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  33.49 
 
 		 1158 aa  224  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  34.1 
 
 		 1060 aa  223  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  36.04 
 
 		 1085 aa  219  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  35.79 
 
 		 960 aa  218  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 1137 aa  217  8e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  34.59 
 
 		 922 aa  216  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  35.46 
 
 		 921 aa  207  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  33.48 
 
 		 952 aa  207  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  34.96 
 
 		 963 aa  204  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  36.86 
 
 		 840 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  41.84 
 
 		 824 aa  204  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  33.77 
 
 		 827 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  31.4 
 
 		 999 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 943 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 887 aa  199  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  41.85 
 
 		 886 aa  198  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  34.61 
 
 		 1085 aa  197  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  33.74 
 
 		 950 aa  196  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  30.01 
 
 		 1048 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  34.81 
 
 		 941 aa  195  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  28.95 
 
 		 816 aa  193  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 1141 aa  189  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 980 aa  189  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  40.59 
 
 		 948 aa  187  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  32.88 
 
 		 1005 aa  187  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  40 
 
 		 973 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  39.88 
 
 		 948 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  36.76 
 
 		 951 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.99 
 
 		 877 aa  185  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 973 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  41.25 
 
 		 755 aa  185  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  34.42 
 
 		 1028 aa  184  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 882 aa  184  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  38.9 
 
 		 775 aa  184  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  35.03 
 
 		 765 aa  183  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 931 aa  181  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 878 aa  180  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  32.06 
 
 		 701 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  35.25 
 
 		 792 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 966 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 658 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  37.57 
 
 		 973 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  34.22 
 
 		 1119 aa  176  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 781 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 814 aa  175  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  36.52 
 
 		 916 aa  173  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 1010 aa  172  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  35.82 
 
 		 1227 aa  171  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  37.03 
 
 		 760 aa  170  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 1027 aa  168  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  33.83 
 
 		 818 aa  169  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.13 
 
 		 1056 aa  169  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 1064 aa  168  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  39.82 
 
 		 1001 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 393 aa  164  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  34.47 
 
 		 799 aa  164  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  33.86 
 
 		 1044 aa  162  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  37.82 
 
 		 919 aa  162  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  34.14 
 
 		 1014 aa  161  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  36.66 
 
 		 780 aa  161  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 950 aa  161  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 591 aa  161  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 906 aa  160  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  38.19 
 
 		 591 aa  160  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>