More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1585 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  54.75 
 
 		 963 aa  867    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  100 
 
 		 980 aa  1884    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  54.84 
 
 		 941 aa  822    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  54.01 
 
 		 943 aa  859    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 1141 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.84 
 
 		 957 aa  343  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  53.33 
 
 		 878 aa  339  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  38.9 
 
 		 969 aa  327  7e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  40.21 
 
 		 1042 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  39.01 
 
 		 952 aa  323  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.11 
 
 		 1092 aa  323  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  39.78 
 
 		 1102 aa  321  3.9999999999999996e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.65 
 
 		 960 aa  314  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  38.58 
 
 		 1066 aa  310  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  39.86 
 
 		 1087 aa  308  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  36.7 
 
 		 1043 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.75 
 
 		 1017 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.14 
 
 		 1125 aa  303  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  37.92 
 
 		 1058 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.05 
 
 		 1100 aa  299  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  36.65 
 
 		 1050 aa  298  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 1058 aa  297  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  36.67 
 
 		 1056 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  37.12 
 
 		 1158 aa  288  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.96 
 
 		 1110 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  39.35 
 
 		 1072 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.93 
 
 		 1055 aa  272  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 1082 aa  266  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  37.2 
 
 		 1018 aa  266  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  35.06 
 
 		 1097 aa  266  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.85 
 
 		 1036 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  36.88 
 
 		 1093 aa  263  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.06 
 
 		 1103 aa  250  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  33.96 
 
 		 1049 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.3 
 
 		 943 aa  248  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  37.05 
 
 		 922 aa  239  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.22 
 
 		 999 aa  239  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  36.11 
 
 		 1060 aa  238  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 1094 aa  237  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.51 
 
 		 1085 aa  233  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  34.77 
 
 		 1131 aa  232  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  39.03 
 
 		 1028 aa  228  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 1137 aa  228  6e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  41.85 
 
 		 931 aa  227  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 1005 aa  226  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  44.19 
 
 		 951 aa  225  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  34.6 
 
 		 1064 aa  224  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  41.28 
 
 		 887 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  36.69 
 
 		 1048 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  34.75 
 
 		 701 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 781 aa  219  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  37.53 
 
 		 792 aa  219  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 882 aa  213  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  40.29 
 
 		 919 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  37.35 
 
 		 1005 aa  211  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 1085 aa  208  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 755 aa  207  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 601 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  31.63 
 
 		 1076 aa  206  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  40.16 
 
 		 973 aa  205  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  40.39 
 
 		 948 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  40.53 
 
 		 973 aa  204  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  39.63 
 
 		 840 aa  204  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  35.95 
 
 		 760 aa  204  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 775 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  34.02 
 
 		 1049 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  37.67 
 
 		 966 aa  202  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  34.51 
 
 		 928 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 877 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  39.62 
 
 		 1119 aa  198  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  39.11 
 
 		 972 aa  197  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  41.58 
 
 		 601 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  41.58 
 
 		 601 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  34.98 
 
 		 630 aa  197  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  35.99 
 
 		 824 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  41.22 
 
 		 948 aa  197  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  33.44 
 
 		 1100 aa  196  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2078  transcriptional regulator, LuxR family  41.55 
 
 		 940 aa  196  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.9735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 814 aa  195  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 765 aa  194  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  33.11 
 
 		 816 aa  194  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  38.59 
 
 		 916 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  36.27 
 
 		 776 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  33.75 
 
 		 950 aa  191  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.45 
 
 		 1227 aa  191  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 658 aa  188  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  35.99 
 
 		 1014 aa  188  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 831 aa  188  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  35.75 
 
 		 1079 aa  187  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  36.75 
 
 		 973 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 886 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  40.57 
 
 		 591 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  41.65 
 
 		 591 aa  184  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  38.35 
 
 		 1001 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  39.79 
 
 		 1010 aa  183  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 888 aa  184  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  34.43 
 
 		 780 aa  182  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  37.09 
 
 		 1161 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  35.55 
 
 		 618 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  36.57 
 
 		 1186 aa  183  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>