More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2197 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  78.79 
 
 		 630 aa  930    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  100 
 
 		 630 aa  1231    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  35.08 
 
 		 952 aa  258  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  34.44 
 
 		 969 aa  241  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  35.35 
 
 		 1017 aa  240  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  33.44 
 
 		 1125 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  35.14 
 
 		 1087 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  34.84 
 
 		 1110 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  33 
 
 		 957 aa  221  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  34.06 
 
 		 1050 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  33.71 
 
 		 1066 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 1049 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  33.76 
 
 		 1042 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  33.07 
 
 		 1058 aa  214  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  34.19 
 
 		 960 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  34.19 
 
 		 1056 aa  214  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  33.44 
 
 		 1093 aa  213  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 1043 aa  209  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  33.02 
 
 		 1100 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  33.82 
 
 		 943 aa  209  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  35.52 
 
 		 1036 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  34.23 
 
 		 1102 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  33.59 
 
 		 1092 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  34.21 
 
 		 1055 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 1082 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  31.5 
 
 		 1103 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  32.82 
 
 		 1158 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  33.39 
 
 		 1018 aa  190  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  34.07 
 
 		 1072 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  32.12 
 
 		 943 aa  188  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  31.99 
 
 		 1097 aa  187  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  32.86 
 
 		 1058 aa  183  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 963 aa  181  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  34.6 
 
 		 922 aa  177  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  33.44 
 
 		 941 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  34.1 
 
 		 1048 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 980 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  33.59 
 
 		 1054 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  35.06 
 
 		 701 aa  168  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  30.54 
 
 		 1064 aa  167  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  32.44 
 
 		 1005 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  28.78 
 
 		 999 aa  163  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 1027 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  31.66 
 
 		 1186 aa  162  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  33.8 
 
 		 1094 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  34.2 
 
 		 1028 aa  158  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 921 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  36.31 
 
 		 887 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  31.83 
 
 		 1100 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  32.56 
 
 		 1060 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  38.62 
 
 		 755 aa  153  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  36.9 
 
 		 1085 aa  153  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  30.88 
 
 		 1049 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 775 aa  152  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  29.51 
 
 		 1131 aa  151  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 1137 aa  150  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  32.84 
 
 		 950 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  30.86 
 
 		 996 aa  150  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 910 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 882 aa  147  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 1064 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.94 
 
 		 760 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  37.27 
 
 		 919 aa  144  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  30.83 
 
 		 981 aa  143  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 781 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  30.2 
 
 		 1003 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 972 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  33.54 
 
 		 961 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  34.01 
 
 		 886 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 922 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  32.72 
 
 		 1044 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  34.3 
 
 		 906 aa  137  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  36.52 
 
 		 878 aa  137  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  31.65 
 
 		 965 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  32.72 
 
 		 792 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  33.98 
 
 		 824 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  33.75 
 
 		 1005 aa  135  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  27.37 
 
 		 1017 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  35.65 
 
 		 916 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  32.57 
 
 		 1088 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 888 aa  134  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  32.94 
 
 		 907 aa  134  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  32.49 
 
 		 827 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 973 aa  133  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 831 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  36.98 
 
 		 768 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 591 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 393 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.56 
 
 		 1104 aa  131  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 812 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 418 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 814 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  35.07 
 
 		 765 aa  130  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  34.8 
 
 		 779 aa  130  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  29.23 
 
 		 964 aa  130  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  29.98 
 
 		 930 aa  130  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  33.42 
 
 		 992 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 591 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  33.43 
 
 		 1119 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  31.12 
 
 		 928 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>