More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2380 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  100 
 
 
618 aa  1235    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  67.94 
 
 
1014 aa  729    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  49.29 
 
 
973 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  46.9 
 
 
973 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  46.66 
 
 
973 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  47.01 
 
 
948 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  51.46 
 
 
948 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  49.79 
 
 
493 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  49.79 
 
 
493 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  49.58 
 
 
493 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  42.71 
 
 
1010 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  42.29 
 
 
877 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  39.09 
 
 
966 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  42.27 
 
 
601 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  40.49 
 
 
658 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  41.61 
 
 
1001 aa  360  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  45 
 
 
481 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  42.27 
 
 
601 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  42.12 
 
 
591 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  42.27 
 
 
601 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  42.88 
 
 
591 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 
950 aa  346  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  41.17 
 
 
972 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  46.07 
 
 
468 aa  342  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  49.75 
 
 
502 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  39.78 
 
 
921 aa  329  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  35.65 
 
 
928 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  35.55 
 
 
956 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  35.43 
 
 
959 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  35.43 
 
 
950 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4035  transcriptional regulator, winged helix family  34.16 
 
 
946 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  32.26 
 
 
961 aa  255  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  33.96 
 
 
490 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  37.59 
 
 
954 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  35.69 
 
 
922 aa  247  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  35.81 
 
 
953 aa  245  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 
906 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.1 
 
 
1102 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  36.83 
 
 
1087 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  40.31 
 
 
1050 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  41.08 
 
 
1092 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  35.86 
 
 
1085 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  39.89 
 
 
1066 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  36.87 
 
 
1085 aa  206  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  39.88 
 
 
1093 aa  205  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.44 
 
 
1125 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  32.85 
 
 
504 aa  204  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5402  transcriptional regulator, winged helix family  38.92 
 
 
901 aa  204  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  38.2 
 
 
1042 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 
781 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  42.13 
 
 
1055 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  38.73 
 
 
1058 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 
1058 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 
1049 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.54 
 
 
999 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  32.14 
 
 
701 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  35.81 
 
 
1227 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  40.4 
 
 
1056 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
775 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.4 
 
 
1017 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
882 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  41.85 
 
 
1119 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  30.99 
 
 
888 aa  195  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  36.7 
 
 
916 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  39.94 
 
 
840 aa  194  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.58 
 
 
816 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  36.34 
 
 
887 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  34.5 
 
 
901 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  38.99 
 
 
886 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
1137 aa  189  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 
818 aa  187  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  35.97 
 
 
1103 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  37.43 
 
 
824 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  36.07 
 
 
827 aa  183  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 
1141 aa  183  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  40.75 
 
 
1110 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  38.67 
 
 
1060 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  39.07 
 
 
1072 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 
957 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  35.83 
 
 
952 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  33.33 
 
 
792 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  38.15 
 
 
1043 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  32.94 
 
 
760 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
736 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.6 
 
 
1097 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 
943 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  38.4 
 
 
1076 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  36.27 
 
 
1049 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  32.62 
 
 
776 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
393 aa  173  9e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  36.27 
 
 
765 aa  173  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 
1060 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  38.21 
 
 
969 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  38.94 
 
 
1161 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  39.07 
 
 
1034 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  36.24 
 
 
1048 aa  167  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  34.32 
 
 
799 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  36.26 
 
 
1100 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 
1158 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  34.99 
 
 
755 aa  165  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>