More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1995 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  55.03 
 
 		 1141 aa  734    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 878 aa  1723    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  61.2 
 
 		 943 aa  382  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  42.42 
 
 		 1085 aa  331  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  52.3 
 
 		 980 aa  331  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  52.49 
 
 		 941 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  51.32 
 
 		 963 aa  307  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 1137 aa  290  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 1085 aa  281  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  42.75 
 
 		 1087 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  44.48 
 
 		 952 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  41.71 
 
 		 957 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  41.76 
 
 		 1042 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  44.47 
 
 		 781 aa  231  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 1058 aa  228  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  42.9 
 
 		 887 aa  225  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  44.41 
 
 		 969 aa  224  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  42.94 
 
 		 1066 aa  224  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  42.07 
 
 		 1050 aa  223  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  35.5 
 
 		 907 aa  221  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  42.27 
 
 		 755 aa  218  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  37.74 
 
 		 760 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  37.08 
 
 		 701 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  40.05 
 
 		 824 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  41.32 
 
 		 1131 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 765 aa  214  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 1049 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  44.67 
 
 		 1036 aa  212  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  37.43 
 
 		 816 aa  211  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  44.51 
 
 		 1072 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  42.37 
 
 		 1110 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  42.82 
 
 		 1093 aa  208  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 931 aa  207  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.36 
 
 		 1102 aa  207  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 921 aa  206  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  40.66 
 
 		 1100 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 393 aa  204  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 882 aa  204  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  36.97 
 
 		 792 aa  202  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 775 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  40.93 
 
 		 1058 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 950 aa  201  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 886 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.04 
 
 		 960 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  41.09 
 
 		 1018 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  43.36 
 
 		 972 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  39.69 
 
 		 1092 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 973 aa  199  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  34.2 
 
 		 982 aa  198  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  40.62 
 
 		 1119 aa  199  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 901 aa  198  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 966 aa  197  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  40.06 
 
 		 840 aa  197  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  39.26 
 
 		 1055 aa  197  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  40.92 
 
 		 973 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  37.19 
 
 		 1097 aa  195  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  40.56 
 
 		 919 aa  195  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 1027 aa  195  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 877 aa  194  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  38.64 
 
 		 1056 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 601 aa  194  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  40.63 
 
 		 973 aa  194  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.5 
 
 		 1125 aa  194  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 591 aa  193  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 1010 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  42.43 
 
 		 951 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  39.94 
 
 		 948 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 922 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  39.95 
 
 		 1094 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 1043 aa  191  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  42.81 
 
 		 1049 aa  191  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  40.72 
 
 		 1064 aa  191  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.89 
 
 		 916 aa  190  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.42 
 
 		 1017 aa  190  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 591 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  40.46 
 
 		 948 aa  189  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 1082 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 1227 aa  188  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 1158 aa  187  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  41.54 
 
 		 1100 aa  187  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  37.08 
 
 		 999 aa  187  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  42.39 
 
 		 601 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  42.39 
 
 		 601 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  40.06 
 
 		 799 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  38.92 
 
 		 658 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 961 aa  185  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  35.26 
 
 		 959 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 		 818 aa  184  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 831 aa  183  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  37.56 
 
 		 1060 aa  181  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  37.28 
 
 		 678 aa  182  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  35 
 
 		 780 aa  180  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 1001 aa  178  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 618 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 1076 aa  174  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  39.87 
 
 		 938 aa  174  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  35.31 
 
 		 928 aa  173  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 814 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.6 
 
 		 1103 aa  173  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3572  transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 914 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>