More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0364 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  100 
 
 		 982 aa  1917    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  84.12 
 
 		 907 aa  1397    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  37.72 
 
 		 1085 aa  350  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6225  putative adenylate/guanylate cyclase  41.59 
 
 		 532 aa  329  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 1137 aa  304  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 1085 aa  300  6e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.84 
 
 		 999 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  33.15 
 
 		 824 aa  240  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  31.84 
 
 		 701 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 814 aa  226  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  33.85 
 
 		 1141 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 781 aa  223  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  32.53 
 
 		 840 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  35.44 
 
 		 1050 aa  221  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  38.6 
 
 		 1055 aa  221  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  37.62 
 
 		 957 aa  220  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  42.19 
 
 		 1058 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  41.78 
 
 		 755 aa  217  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  31.3 
 
 		 768 aa  216  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  40.04 
 
 		 886 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 775 aa  213  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 882 aa  212  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  38.5 
 
 		 1087 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  36.33 
 
 		 799 aa  209  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 		 1066 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  40.66 
 
 		 969 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  32.36 
 
 		 792 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  39.34 
 
 		 1056 aa  205  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  41.21 
 
 		 760 aa  204  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  39.42 
 
 		 1042 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  35.84 
 
 		 1092 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  36.3 
 
 		 960 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  35.41 
 
 		 887 aa  202  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  35.22 
 
 		 765 aa  200  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  31.67 
 
 		 776 aa  200  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  34.2 
 
 		 878 aa  199  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  39.41 
 
 		 951 aa  198  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 931 aa  198  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 		 816 aa  197  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  36.57 
 
 		 1058 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  39.83 
 
 		 1119 aa  196  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.64 
 
 		 1125 aa  194  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 393 aa  194  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  31.89 
 
 		 916 aa  191  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  29.06 
 
 		 777 aa  190  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 910 aa  189  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 966 aa  189  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.5 
 
 		 1036 aa  188  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 1082 aa  187  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  33.56 
 
 		 827 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.28 
 
 		 877 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 952 aa  184  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  33.12 
 
 		 818 aa  183  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.47 
 
 		 1017 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  38.52 
 
 		 919 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  31.26 
 
 		 779 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.46 
 
 		 1102 aa  180  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 1100 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  38.48 
 
 		 601 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  40.06 
 
 		 1093 aa  177  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  35.19 
 
 		 678 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 591 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 1227 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.54 
 
 		 1110 aa  174  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  41.71 
 
 		 1027 aa  173  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 1043 aa  173  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  38.9 
 
 		 591 aa  173  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 928 aa  172  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  38.73 
 
 		 601 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  38.73 
 
 		 601 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  34.41 
 
 		 1014 aa  172  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 1094 aa  171  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 972 aa  169  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  29.62 
 
 		 961 aa  169  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  33.19 
 
 		 1103 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 1097 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2078  transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 940 aa  164  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.9735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 906 aa  164  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 973 aa  164  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  35.6 
 
 		 1010 aa  164  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 		 1049 aa  164  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  35.62 
 
 		 780 aa  163  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 953 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  27.86 
 
 		 888 aa  162  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  30.34 
 
 		 950 aa  161  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 973 aa  161  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  30.29 
 
 		 921 aa  161  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  32.39 
 
 		 956 aa  160  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  33.41 
 
 		 618 aa  160  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  33.26 
 
 		 943 aa  158  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 948 aa  157  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 941 aa  157  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0128  transcriptional regulator  37.92 
 
 		 695 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 963 aa  155  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 943 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 973 aa  154  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  37.66 
 
 		 1060 aa  153  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 658 aa  151  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  36.02 
 
 		 1001 aa  150  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  36.86 
 
 		 948 aa  150  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>