178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0128 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0128  transcriptional regulator  100 
 
 		 695 aa  1337    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  33.09 
 
 		 957 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 952 aa  211  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 755 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.91 
 
 		 1227 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  37.02 
 
 		 1066 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  38.61 
 
 		 840 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  35.88 
 
 		 887 aa  160  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  32.62 
 
 		 1102 aa  158  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.94 
 
 		 1058 aa  157  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 1097 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.88 
 
 		 916 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 882 aa  154  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 928 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 1137 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  30.35 
 
 		 1103 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  38.34 
 
 		 907 aa  152  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  39.42 
 
 		 1119 aa  150  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  31.1 
 
 		 1049 aa  150  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.52 
 
 		 1017 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  39.01 
 
 		 973 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 973 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 1141 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  31.68 
 
 		 1085 aa  148  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 775 aa  149  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  26.66 
 
 		 816 aa  148  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  36.2 
 
 		 1131 aa  148  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 961 aa  148  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  38.68 
 
 		 1056 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  37.28 
 
 		 1087 aa  147  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.75 
 
 		 1125 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  37.92 
 
 		 982 aa  146  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  37.63 
 
 		 921 aa  146  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  36.36 
 
 		 776 aa  145  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  40.27 
 
 		 954 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  40.47 
 
 		 1092 aa  144  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  40.13 
 
 		 948 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  34.41 
 
 		 799 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  35.22 
 
 		 618 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  37.69 
 
 		 765 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 781 aa  142  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 490 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  31.79 
 
 		 960 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  39.93 
 
 		 948 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 888 aa  140  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  36.05 
 
 		 943 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  38.68 
 
 		 878 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  33.87 
 
 		 701 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 1082 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 975 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  37.28 
 
 		 1056 aa  137  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  36.75 
 
 		 973 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  40.33 
 
 		 1110 aa  137  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  34.73 
 
 		 1042 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 901 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  32.83 
 
 		 779 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  32.39 
 
 		 792 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  33.84 
 
 		 777 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  34.4 
 
 		 760 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  33.13 
 
 		 1050 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  35.38 
 
 		 1100 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  36.36 
 
 		 824 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.76 
 
 		 999 aa  134  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 726 aa  134  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  34.66 
 
 		 877 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  39.8 
 
 		 1048 aa  134  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  35.62 
 
 		 678 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 		 1058 aa  133  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  33.55 
 
 		 959 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.49 
 
 		 1036 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  30.33 
 
 		 953 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  35.74 
 
 		 1014 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3572  transcriptional regulator, LuxR family  44.09 
 
 		 914 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 393 aa  132  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  36.81 
 
 		 980 aa  132  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  38.41 
 
 		 919 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 		 768 aa  131  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  35.57 
 
 		 1055 aa  131  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 736 aa  130  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  41.13 
 
 		 418 aa  130  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1062  transcriptional regulator, LuxR family  34.44 
 
 		 933 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 886 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  38 
 
 		 1093 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  38.08 
 
 		 1100 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 910 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.81 
 
 		 1104 aa  129  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  30.45 
 
 		 1027 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  37.87 
 
 		 1072 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 950 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  40.96 
 
 		 1005 aa  127  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  30.63 
 
 		 956 aa  127  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  35.08 
 
 		 972 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 1076 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 1085 aa  124  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  31.81 
 
 		 1043 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 831 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  40.51 
 
 		 1005 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 969 aa  124  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 812 aa  124  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  33.43 
 
 		 1060 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>