More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1957 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  100 
 
 		 490 aa  974    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  48.73 
 
 		 928 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  38.76 
 
 		 956 aa  298  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  38.48 
 
 		 961 aa  289  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 877 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  37.24 
 
 		 950 aa  279  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  37.42 
 
 		 959 aa  279  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  35.86 
 
 		 966 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  38.51 
 
 		 1010 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  36.53 
 
 		 973 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  36.53 
 
 		 973 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4035  transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 		 946 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  37.34 
 
 		 1001 aa  267  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  38.61 
 
 		 954 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  34.43 
 
 		 1014 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 922 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 591 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 973 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  37.07 
 
 		 591 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  36.33 
 
 		 972 aa  256  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 618 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 658 aa  253  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  38.31 
 
 		 601 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 948 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  38.53 
 
 		 601 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  38.53 
 
 		 601 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  35.46 
 
 		 948 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  34.81 
 
 		 504 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 481 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  36.18 
 
 		 953 aa  241  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  34.16 
 
 		 950 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  35.95 
 
 		 921 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 493 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 493 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  33.83 
 
 		 493 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  36.14 
 
 		 906 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 468 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 1066 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 502 aa  223  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  39.83 
 
 		 701 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  39.26 
 
 		 792 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  37.37 
 
 		 999 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.31 
 
 		 1125 aa  213  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  39.44 
 
 		 1042 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 		 1058 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  36.91 
 
 		 824 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 781 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 775 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  36.86 
 
 		 1085 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.78 
 
 		 1058 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 814 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 765 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  38.62 
 
 		 886 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5402  transcriptional regulator, winged helix family  36.98 
 
 		 901 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 1137 aa  200  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 1097 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  36.22 
 
 		 1087 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 816 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  37.26 
 
 		 1056 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.1 
 
 		 1017 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  35.77 
 
 		 1050 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.87 
 
 		 1102 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37.71 
 
 		 952 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  39.2 
 
 		 1093 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 1100 aa  190  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 882 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  37.36 
 
 		 755 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  37.75 
 
 		 776 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 1049 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  37.6 
 
 		 799 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  37.03 
 
 		 1060 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  37.72 
 
 		 887 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  37.85 
 
 		 916 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  37.47 
 
 		 760 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  39.01 
 
 		 840 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  35.98 
 
 		 1103 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  38.16 
 
 		 1055 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  35.37 
 
 		 1092 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  38.38 
 
 		 1072 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  38.23 
 
 		 1119 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  35.69 
 
 		 931 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 393 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  35.18 
 
 		 1110 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 1082 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 901 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 		 818 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  35.96 
 
 		 960 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 1085 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  35.81 
 
 		 779 aa  170  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.23 
 
 		 827 aa  169  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  33.14 
 
 		 780 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  35.21 
 
 		 957 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 831 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  38.06 
 
 		 951 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 		 1227 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 888 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 1043 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  36.8 
 
 		 938 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 418 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.14 
 
 		 1036 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>