More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4166 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 1049 aa  2055    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 1042 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  38.69 
 
 		 1050 aa  525  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  41.77 
 
 		 1072 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  38.41 
 
 		 1100 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  38.82 
 
 		 1093 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  38.03 
 
 		 1056 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  38.21 
 
 		 1087 aa  505  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  41.86 
 
 		 1058 aa  500  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  40.73 
 
 		 1110 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.9 
 
 		 1043 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 		 1058 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  44.76 
 
 		 1036 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.25 
 
 		 1097 aa  473  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  36.38 
 
 		 1066 aa  472  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.08 
 
 		 1125 aa  445  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 1082 aa  445  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.56 
 
 		 1103 aa  429  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  41.69 
 
 		 1060 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  35.88 
 
 		 1055 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  38.92 
 
 		 1094 aa  399  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 1005 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.61 
 
 		 1092 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.58 
 
 		 1102 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  35.41 
 
 		 1017 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  37.57 
 
 		 1028 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  42 
 
 		 1048 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  39.11 
 
 		 952 aa  353  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  37.11 
 
 		 957 aa  334  5e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.06 
 
 		 960 aa  329  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 922 aa  320  7.999999999999999e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  34.89 
 
 		 969 aa  304  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  31.55 
 
 		 999 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 1227 aa  302  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  32.49 
 
 		 1064 aa  296  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  37.04 
 
 		 1158 aa  296  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 781 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  32.49 
 
 		 1018 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37.35 
 
 		 943 aa  281  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  40.97 
 
 		 1119 aa  280  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 		 1005 aa  280  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 1186 aa  273  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  35.53 
 
 		 824 aa  271  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  43.82 
 
 		 840 aa  270  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  33.98 
 
 		 701 aa  269  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  36.76 
 
 		 1049 aa  268  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  35.97 
 
 		 1085 aa  266  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  42.01 
 
 		 792 aa  261  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  38.81 
 
 		 760 aa  255  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 816 aa  253  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 886 aa  251  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  34.1 
 
 		 941 aa  250  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  35.46 
 
 		 1076 aa  250  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 963 aa  249  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  32.57 
 
 		 1131 aa  249  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  35.67 
 
 		 1079 aa  248  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 765 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 1034 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  33.29 
 
 		 799 aa  241  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  32.3 
 
 		 1060 aa  241  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  32.32 
 
 		 780 aa  241  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 1085 aa  239  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 775 aa  238  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 1161 aa  236  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  34.51 
 
 		 818 aa  234  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  38.88 
 
 		 827 aa  234  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  40.05 
 
 		 755 aa  232  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 882 aa  231  6e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 887 aa  231  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  36.27 
 
 		 950 aa  231  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  36.23 
 
 		 921 aa  229  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 1137 aa  228  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  32.59 
 
 		 1100 aa  228  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 		 768 aa  224  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  38.38 
 
 		 916 aa  224  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  38.43 
 
 		 972 aa  223  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 959 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  38.52 
 
 		 950 aa  221  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 814 aa  220  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  41.19 
 
 		 1141 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  38.46 
 
 		 776 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 980 aa  216  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  30.46 
 
 		 888 aa  215  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  38.68 
 
 		 953 aa  213  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 630 aa  210  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  35.46 
 
 		 928 aa  209  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  39.84 
 
 		 1010 aa  208  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  38.42 
 
 		 922 aa  208  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 901 aa  208  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  36.87 
 
 		 961 aa  208  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 736 aa  208  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  32.02 
 
 		 943 aa  207  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 831 aa  205  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  35.17 
 
 		 678 aa  205  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  34.34 
 
 		 630 aa  204  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 393 aa  204  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  34.53 
 
 		 779 aa  204  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  38.69 
 
 		 973 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 799 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  40 
 
 		 1001 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>