More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0992 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 814 aa  1617    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  45.28 
 
 		 792 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 775 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  45.34 
 
 		 960 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  39.05 
 
 		 776 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  37.75 
 
 		 701 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  40.5 
 
 		 755 aa  389  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  38.54 
 
 		 840 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  38.84 
 
 		 780 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  38.75 
 
 		 765 aa  355  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 781 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  38.43 
 
 		 678 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  38.6 
 
 		 760 aa  326  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  33.41 
 
 		 824 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 816 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  42.63 
 
 		 1085 aa  304  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  34.71 
 
 		 768 aa  296  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  35.47 
 
 		 886 aa  295  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  33.62 
 
 		 799 aa  295  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.93 
 
 		 999 aa  291  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  45.41 
 
 		 1102 aa  290  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  30.98 
 
 		 777 aa  290  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 1137 aa  290  9e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  41.41 
 
 		 1055 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.23 
 
 		 1125 aa  285  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  42.15 
 
 		 1092 aa  282  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  40.84 
 
 		 1066 aa  280  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  35.25 
 
 		 1119 aa  273  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  35.96 
 
 		 1017 aa  273  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  39.96 
 
 		 1100 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  42.01 
 
 		 1056 aa  269  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  34.72 
 
 		 644 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37.94 
 
 		 952 aa  267  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  41.84 
 
 		 1087 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  39.79 
 
 		 1050 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  34.88 
 
 		 969 aa  261  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 901 aa  260  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  37.12 
 
 		 916 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 882 aa  257  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 1085 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  35.09 
 
 		 921 aa  255  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 1042 aa  253  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  39.74 
 
 		 1103 aa  252  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 972 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  40.59 
 
 		 1058 aa  251  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  42.41 
 
 		 887 aa  250  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 799 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  41.4 
 
 		 1227 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  34.47 
 
 		 818 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  43.22 
 
 		 1110 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  33.05 
 
 		 982 aa  243  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 957 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 1097 aa  240  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  41.4 
 
 		 1036 aa  240  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  33.66 
 
 		 907 aa  240  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 1093 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.19 
 
 		 877 aa  239  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  40.39 
 
 		 601 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 966 aa  235  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  36.93 
 
 		 1049 aa  235  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  36.71 
 
 		 1056 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 591 aa  227  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  38.73 
 
 		 601 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  38.73 
 
 		 601 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  33.85 
 
 		 950 aa  226  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  40.06 
 
 		 490 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  38.66 
 
 		 591 aa  226  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  33.26 
 
 		 888 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 1082 aa  224  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  44.38 
 
 		 418 aa  224  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  39.17 
 
 		 1060 aa  222  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 928 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  37.53 
 
 		 1001 aa  220  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  36.6 
 
 		 1043 aa  220  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  35.49 
 
 		 1010 aa  220  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 975 aa  217  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.98 
 
 		 827 aa  216  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1065  ATPase-like protein  34.25 
 
 		 649 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.444255  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 393 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  37.77 
 
 		 1058 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  40.2 
 
 		 1158 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 910 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  39.44 
 
 		 1072 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  31.96 
 
 		 1018 aa  212  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  40.58 
 
 		 943 aa  210  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  43.7 
 
 		 951 aa  204  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 1005 aa  203  9e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  37.06 
 
 		 1049 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 1094 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  34.33 
 
 		 906 aa  201  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 919 aa  200  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 973 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 1076 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  39.8 
 
 		 931 aa  198  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  34.01 
 
 		 961 aa  198  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  35.02 
 
 		 953 aa  197  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 798 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 1141 aa  195  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 812 aa  195  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  34.26 
 
 		 1064 aa  192  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>