More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2859 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  100 
 
 
999 aa  1965    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  35.98 
 
 
816 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  34.38 
 
 
1092 aa  351  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  36.38 
 
 
792 aa  347  8e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  35.37 
 
 
824 aa  337  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
781 aa  327  8.000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  35.33 
 
 
799 aa  326  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  32.92 
 
 
701 aa  325  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  33.81 
 
 
1103 aa  324  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  32.9 
 
 
975 aa  320  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  31.93 
 
 
1017 aa  320  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  37.05 
 
 
1119 aa  320  7e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  33.94 
 
 
1125 aa  319  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  36.26 
 
 
1087 aa  317  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.77 
 
 
1085 aa  309  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  35.06 
 
 
840 aa  303  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.47 
 
 
1055 aa  302  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  37.09 
 
 
886 aa  302  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.5 
 
 
1102 aa  301  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 
1066 aa  300  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  32.37 
 
 
960 aa  300  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  34.35 
 
 
1050 aa  297  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  34.97 
 
 
1042 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  35.53 
 
 
1056 aa  296  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  35.21 
 
 
1043 aa  294  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  38.48 
 
 
1137 aa  292  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 
1058 aa  291  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  31.44 
 
 
1049 aa  290  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  34.54 
 
 
1100 aa  284  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  40.69 
 
 
1085 aa  281  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  32.4 
 
 
1093 aa  280  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  35.3 
 
 
775 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  32.24 
 
 
901 aa  274  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  33.46 
 
 
1227 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  33.61 
 
 
765 aa  267  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 
1097 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  34.09 
 
 
952 aa  265  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  34.69 
 
 
957 aa  261  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  34.95 
 
 
780 aa  261  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  31.79 
 
 
888 aa  261  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  33.97 
 
 
1036 aa  261  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
736 aa  260  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.81 
 
 
1056 aa  260  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  34.61 
 
 
814 aa  259  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  37.39 
 
 
972 aa  259  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
799 aa  259  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 
921 aa  259  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  36.7 
 
 
1058 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  32.95 
 
 
776 aa  258  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  33.82 
 
 
969 aa  258  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  30.89 
 
 
1064 aa  257  7e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 
910 aa  257  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  29.64 
 
 
831 aa  255  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  38.69 
 
 
887 aa  254  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  37.73 
 
 
882 aa  253  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  37.55 
 
 
907 aa  253  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 
726 aa  253  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  30.25 
 
 
1018 aa  252  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  33.53 
 
 
1072 aa  251  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  29.53 
 
 
996 aa  251  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 
818 aa  250  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
1082 aa  250  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  31.14 
 
 
812 aa  249  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  34.59 
 
 
916 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  32.4 
 
 
797 aa  248  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  36.74 
 
 
950 aa  245  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  35.6 
 
 
1110 aa  244  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 
798 aa  242  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 
1094 aa  242  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 
1005 aa  242  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  33 
 
 
827 aa  241  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  39 
 
 
973 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  36.38 
 
 
877 aa  239  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  38.83 
 
 
601 aa  239  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  30.19 
 
 
1044 aa  239  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.05 
 
 
760 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  32.24 
 
 
678 aa  239  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  34.76 
 
 
1060 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  32.38 
 
 
840 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  35.36 
 
 
755 aa  234  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  32.84 
 
 
982 aa  234  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.53 
 
 
1104 aa  233  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  38.42 
 
 
591 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  27.98 
 
 
872 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  30.4 
 
 
992 aa  228  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  38.59 
 
 
601 aa  227  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  38.59 
 
 
601 aa  227  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  36.23 
 
 
591 aa  226  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  31.61 
 
 
768 aa  225  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  35.55 
 
 
779 aa  225  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  38.46 
 
 
658 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.43 
 
 
966 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  31.01 
 
 
928 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  25.53 
 
 
1050 aa  222  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  35.37 
 
 
922 aa  223  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  32.75 
 
 
1010 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  32.76 
 
 
956 aa  219  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  28.38 
 
 
802 aa  219  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  29.68 
 
 
777 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  38.25 
 
 
1048 aa  218  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>