More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2768 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 1050 aa  2136    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 1064 aa  310  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  27.9 
 
 		 1044 aa  291  6e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  27.8 
 
 		 991 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  27.44 
 
 		 992 aa  231  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  25.53 
 
 		 999 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  26.74 
 
 		 996 aa  221  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 799 aa  196  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  26.13 
 
 		 1056 aa  173  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  25.14 
 
 		 1145 aa  166  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  24.38 
 
 		 816 aa  163  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.6 
 
 		 1104 aa  164  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 872 aa  158  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  25.03 
 
 		 901 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  28.29 
 
 		 960 aa  153  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  23.39 
 
 		 1125 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 910 aa  149  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  26.5 
 
 		 1064 aa  147  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 831 aa  146  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  23.2 
 
 		 1092 aa  144  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  26.43 
 
 		 1055 aa  141  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  27.26 
 
 		 802 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  24.75 
 
 		 888 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  30.32 
 
 		 961 aa  137  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  24.43 
 
 		 1066 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 922 aa  135  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  25.58 
 
 		 1102 aa  135  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  25.79 
 
 		 957 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  26.57 
 
 		 1085 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  26.46 
 
 		 1072 aa  128  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  25.04 
 
 		 797 aa  127  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 877 aa  126  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 812 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  25.22 
 
 		 1017 aa  125  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  23.52 
 
 		 1058 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  25.21 
 
 		 824 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  25.68 
 
 		 768 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 726 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 953 aa  122  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  25.51 
 
 		 1036 aa  122  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  24.28 
 
 		 1049 aa  121  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 736 aa  122  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2158  ATPase-like  29.4 
 
 		 856 aa  121  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  23.37 
 
 		 1227 aa  121  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  22.8 
 
 		 975 aa  120  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  26.08 
 
 		 618 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  24.09 
 
 		 952 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  28.11 
 
 		 973 aa  119  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  26.28 
 
 		 1043 aa  119  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  27.74 
 
 		 1014 aa  118  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  25.94 
 
 		 916 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  24.52 
 
 		 1050 aa  118  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  24.17 
 
 		 1087 aa  118  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  22.04 
 
 		 1042 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  28.08 
 
 		 840 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  24.26 
 
 		 1110 aa  117  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 798 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  27.99 
 
 		 973 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  27.06 
 
 		 827 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 781 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  26.62 
 
 		 1100 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  27.4 
 
 		 959 aa  115  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  26.88 
 
 		 1093 aa  114  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  28.19 
 
 		 906 aa  114  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  28.02 
 
 		 969 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  24.69 
 
 		 1058 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  23.44 
 
 		 1119 aa  113  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  25 
 
 		 966 aa  112  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  23.39 
 
 		 1103 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 775 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  28.11 
 
 		 948 aa  112  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  26.84 
 
 		 701 aa  112  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  24.09 
 
 		 1005 aa  112  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 973 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 963 aa  111  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  25.14 
 
 		 1097 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  27.79 
 
 		 950 aa  110  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  27.25 
 
 		 921 aa  110  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  25.85 
 
 		 950 aa  109  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  28.44 
 
 		 943 aa  109  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  24.89 
 
 		 1100 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  21.72 
 
 		 818 aa  108  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  24.68 
 
 		 943 aa  107  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  27.73 
 
 		 948 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  25.95 
 
 		 1010 aa  106  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  25.54 
 
 		 928 aa  107  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  23.87 
 
 		 956 aa  107  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  29.54 
 
 		 931 aa  106  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 1137 aa  105  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  28.46 
 
 		 490 aa  105  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 1082 aa  105  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  25.26 
 
 		 630 aa  105  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  25.32 
 
 		 780 aa  104  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  24.21 
 
 		 954 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 814 aa  104  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 804 aa  104  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  28.76 
 
 		 1001 aa  103  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  26.61 
 
 		 792 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  24.3 
 
 		 941 aa  103  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  23.37 
 
 		 919 aa  102  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>