More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1608 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 802 aa  1612    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  28.43 
 
 		 816 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 910 aa  284  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 975 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 901 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 812 aa  275  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  28.59 
 
 		 831 aa  269  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 804 aa  263  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 799 aa  261  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 872 aa  252  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  28.53 
 
 		 999 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 726 aa  227  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 		 798 aa  227  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  28.53 
 
 		 768 aa  223  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  28.03 
 
 		 886 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  26.75 
 
 		 824 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 779 aa  220  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  28.24 
 
 		 1125 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 736 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  29.92 
 
 		 797 aa  211  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  31.36 
 
 		 916 aa  208  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  33.1 
 
 		 1056 aa  203  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  27.8 
 
 		 1092 aa  203  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  26.48 
 
 		 701 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  32.78 
 
 		 1066 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  29.01 
 
 		 792 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  29.39 
 
 		 1085 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 888 aa  201  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  29.17 
 
 		 1119 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  31.52 
 
 		 1227 aa  200  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 1042 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 729 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 775 aa  197  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  34.07 
 
 		 840 aa  195  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  32.63 
 
 		 1097 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  29.7 
 
 		 1102 aa  191  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  31.18 
 
 		 1058 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  32.41 
 
 		 1058 aa  190  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  34.6 
 
 		 1017 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  31.74 
 
 		 1050 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 814 aa  188  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 781 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  31.73 
 
 		 960 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  28.2 
 
 		 1103 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  25.75 
 
 		 799 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  26.93 
 
 		 765 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  28.04 
 
 		 755 aa  184  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 877 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  26.18 
 
 		 777 aa  183  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  32.22 
 
 		 827 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 882 aa  180  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  33.66 
 
 		 1055 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  27.29 
 
 		 780 aa  179  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  31.65 
 
 		 1093 aa  179  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 966 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  30.07 
 
 		 1087 aa  179  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  29.16 
 
 		 1137 aa  178  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  32.51 
 
 		 601 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  27.29 
 
 		 1044 aa  177  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2158  ATPase-like  27.69 
 
 		 856 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  27.72 
 
 		 1056 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  33.1 
 
 		 1036 aa  175  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  32.51 
 
 		 591 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.39 
 
 		 1104 aa  174  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  34 
 
 		 996 aa  174  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  27.1 
 
 		 1049 aa  174  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  32.27 
 
 		 591 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 1076 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 1082 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  32.69 
 
 		 776 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  31.66 
 
 		 1110 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  29.1 
 
 		 973 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  31.02 
 
 		 887 aa  172  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  32.53 
 
 		 1005 aa  171  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  30.92 
 
 		 973 aa  171  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  32.51 
 
 		 601 aa  171  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  32.51 
 
 		 601 aa  171  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  30.64 
 
 		 973 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  35.75 
 
 		 490 aa  170  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  30.86 
 
 		 1072 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  31.25 
 
 		 1018 aa  170  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 1085 aa  169  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 1043 aa  169  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  30.83 
 
 		 950 aa  168  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  29.14 
 
 		 972 aa  168  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  27.14 
 
 		 921 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  28.19 
 
 		 1010 aa  167  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 1050 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 948 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  26.02 
 
 		 818 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  29.14 
 
 		 957 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 931 aa  165  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 948 aa  164  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  30.92 
 
 		 952 aa  164  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  31.84 
 
 		 943 aa  164  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  33.61 
 
 		 919 aa  163  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  30.23 
 
 		 1064 aa  163  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  32.26 
 
 		 1158 aa  161  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  28.6 
 
 		 1060 aa  160  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  30.32 
 
 		 969 aa  158  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>