More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0719 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
768 aa  1506    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  34.68 
 
 
792 aa  323  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 
816 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  34.63 
 
 
824 aa  310  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  36.6 
 
 
901 aa  308  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
799 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
775 aa  288  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 
910 aa  284  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  33.79 
 
 
799 aa  278  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  34.56 
 
 
886 aa  276  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 
765 aa  276  9e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
814 aa  275  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  32.82 
 
 
701 aa  274  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
781 aa  273  7e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  33.59 
 
 
776 aa  269  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  40.22 
 
 
916 aa  264  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  37.38 
 
 
1119 aa  259  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  32.11 
 
 
975 aa  252  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  29.99 
 
 
872 aa  252  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  33.11 
 
 
1085 aa  251  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  32.8 
 
 
818 aa  250  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  31.5 
 
 
812 aa  250  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  34.82 
 
 
755 aa  250  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  30.37 
 
 
831 aa  246  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
882 aa  245  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
726 aa  244  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  35.36 
 
 
779 aa  243  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
736 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  31.21 
 
 
999 aa  238  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  35.08 
 
 
960 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  33.89 
 
 
840 aa  236  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  33.99 
 
 
1049 aa  234  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
798 aa  233  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  34.71 
 
 
1092 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  30.79 
 
 
888 aa  232  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  31.11 
 
 
797 aa  230  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  41.57 
 
 
1036 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  40.37 
 
 
1087 aa  228  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  40.24 
 
 
1056 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  34.49 
 
 
1125 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  32.81 
 
 
907 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
1085 aa  221  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  34.93 
 
 
1103 aa  220  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
729 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
1137 aa  219  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  35.21 
 
 
1001 aa  218  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  39.41 
 
 
877 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  31.3 
 
 
982 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.48 
 
 
1102 aa  214  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  32.53 
 
 
887 aa  214  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  33.59 
 
 
1227 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  34.33 
 
 
1017 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  35.96 
 
 
1050 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  29.4 
 
 
804 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  30.32 
 
 
1056 aa  211  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  40.65 
 
 
1072 aa  211  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 
1066 aa  211  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  33.94 
 
 
957 aa  211  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 
950 aa  211  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  30.3 
 
 
827 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  36.76 
 
 
1042 aa  208  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  36.07 
 
 
928 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  32.04 
 
 
780 aa  207  8e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  28.19 
 
 
802 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  31.91 
 
 
1097 aa  205  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  32.79 
 
 
1110 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  38.92 
 
 
1043 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  34.6 
 
 
1055 aa  200  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  37.26 
 
 
601 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.21 
 
 
1100 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  34.07 
 
 
966 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  37.56 
 
 
1058 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  33.98 
 
 
972 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 
1005 aa  197  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  32.41 
 
 
1010 aa  196  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.83 
 
 
952 aa  194  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 
969 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  31.14 
 
 
961 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  34.67 
 
 
760 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  37.45 
 
 
950 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  36.05 
 
 
1058 aa  192  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  38.26 
 
 
601 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  38.26 
 
 
601 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  29.77 
 
 
777 aa  191  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  32.56 
 
 
921 aa  190  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  29.04 
 
 
840 aa  184  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.35 
 
 
1104 aa  183  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  33.71 
 
 
678 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  36.57 
 
 
959 aa  181  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 
919 aa  177  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  37.11 
 
 
1093 aa  177  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  31.45 
 
 
973 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  37.22 
 
 
591 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  37.59 
 
 
658 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  32.21 
 
 
1018 aa  174  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  34.01 
 
 
618 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  35.75 
 
 
953 aa  173  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  37.5 
 
 
591 aa  173  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  35.9 
 
 
1060 aa  173  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  37.57 
 
 
973 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>