More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1124 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 816 aa  1662    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  35.98 
 
 		 999 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 901 aa  365  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 910 aa  355  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 		 726 aa  343  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  32.15 
 
 		 975 aa  334  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 888 aa  317  5e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 781 aa  314  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 799 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  32.5 
 
 		 916 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 872 aa  306  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  32.89 
 
 		 768 aa  306  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  31.53 
 
 		 1119 aa  304  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  32.01 
 
 		 792 aa  299  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 736 aa  290  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 804 aa  288  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  29.86 
 
 		 886 aa  286  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  29.2 
 
 		 824 aa  284  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  32.17 
 
 		 1227 aa  282  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  38.19 
 
 		 1066 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 775 aa  280  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  33.46 
 
 		 1085 aa  280  9e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  29.73 
 
 		 960 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  28.59 
 
 		 798 aa  278  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.12 
 
 		 1100 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  30.57 
 
 		 1125 aa  276  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 802 aa  274  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  32.87 
 
 		 1056 aa  273  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 814 aa  273  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  29.36 
 
 		 701 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  31.87 
 
 		 1087 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  30.13 
 
 		 799 aa  269  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  30.24 
 
 		 1092 aa  269  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 779 aa  268  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  31.28 
 
 		 1103 aa  267  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  31.28 
 
 		 840 aa  267  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  28.7 
 
 		 797 aa  263  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 831 aa  261  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 		 765 aa  260  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  31.61 
 
 		 1017 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  29.81 
 
 		 1055 aa  259  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 1085 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 1049 aa  253  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  31.31 
 
 		 1005 aa  251  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  30.94 
 
 		 1042 aa  251  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  30.87 
 
 		 1050 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 1137 aa  249  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 812 aa  247  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  30.46 
 
 		 1102 aa  247  8e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  29.76 
 
 		 818 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  31.34 
 
 		 1097 aa  244  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  36.81 
 
 		 1058 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  32.16 
 
 		 1056 aa  241  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  30.16 
 
 		 1058 aa  241  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  30.62 
 
 		 780 aa  241  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 882 aa  238  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 729 aa  237  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.56 
 
 		 877 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  36.66 
 
 		 601 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  33.15 
 
 		 952 aa  231  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  35.83 
 
 		 1036 aa  230  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  33.26 
 
 		 957 aa  230  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  31.23 
 
 		 1093 aa  228  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  31.55 
 
 		 755 aa  228  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  33.89 
 
 		 887 aa  227  6e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 1094 aa  226  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  30.36 
 
 		 1072 aa  226  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 972 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  30.47 
 
 		 1110 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  36.66 
 
 		 601 aa  220  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  36.66 
 
 		 601 aa  220  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  32.73 
 
 		 950 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  30.54 
 
 		 921 aa  219  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  35.75 
 
 		 1043 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  27.25 
 
 		 776 aa  217  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  31.87 
 
 		 760 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  24.9 
 
 		 777 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 966 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  26.81 
 
 		 827 aa  213  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  30.21 
 
 		 678 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  34.3 
 
 		 1010 aa  212  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 591 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.92 
 
 		 1104 aa  208  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 591 aa  207  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  30.35 
 
 		 996 aa  207  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 973 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  28.63 
 
 		 1060 aa  206  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 1001 aa  204  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 969 aa  204  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 959 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  28.91 
 
 		 961 aa  199  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 490 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  28.06 
 
 		 1018 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  29.92 
 
 		 644 aa  197  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  35.67 
 
 		 973 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  35.39 
 
 		 973 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  29.09 
 
 		 907 aa  194  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  30.58 
 
 		 618 aa  193  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  28.95 
 
 		 1064 aa  193  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  27.38 
 
 		 1044 aa  193  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>