More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4962 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 		 1018 aa  1955    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  34.14 
 
 		 1125 aa  399  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  34.73 
 
 		 1092 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  36.61 
 
 		 1055 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  34.61 
 
 		 1103 aa  363  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  35.96 
 
 		 1017 aa  363  9e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  35.74 
 
 		 1087 aa  363  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  34.84 
 
 		 1043 aa  363  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.44 
 
 		 1102 aa  360  5e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  35.8 
 
 		 1072 aa  358  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  33.54 
 
 		 1100 aa  351  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  38.63 
 
 		 1058 aa  348  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  32.77 
 
 		 1097 aa  337  5.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  33.87 
 
 		 1042 aa  335  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  34.37 
 
 		 1050 aa  334  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.03 
 
 		 969 aa  330  7e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  40.25 
 
 		 1110 aa  318  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  37.48 
 
 		 1066 aa  317  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  37.63 
 
 		 1093 aa  313  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  38.82 
 
 		 1036 aa  312  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37.91 
 
 		 943 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  34.22 
 
 		 1056 aa  303  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  38.09 
 
 		 1058 aa  301  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  35.34 
 
 		 960 aa  298  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  37.46 
 
 		 1158 aa  293  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  32.49 
 
 		 1049 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  38.03 
 
 		 957 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  37.72 
 
 		 1060 aa  283  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  35.09 
 
 		 1028 aa  281  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 952 aa  276  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 1082 aa  273  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  36.1 
 
 		 943 aa  269  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 963 aa  268  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  30.25 
 
 		 999 aa  266  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  32.41 
 
 		 922 aa  259  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  37.15 
 
 		 1048 aa  259  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  34.7 
 
 		 1227 aa  253  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 980 aa  252  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 941 aa  250  9e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  32.55 
 
 		 1094 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  39.77 
 
 		 1186 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  36.85 
 
 		 1064 aa  233  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  34.52 
 
 		 1005 aa  233  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  33.51 
 
 		 1131 aa  230  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  32.93 
 
 		 792 aa  230  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  35.15 
 
 		 1005 aa  228  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  31.32 
 
 		 701 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  37.48 
 
 		 1100 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  36.71 
 
 		 777 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 775 aa  218  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 886 aa  217  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  36.9 
 
 		 916 aa  217  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  35.03 
 
 		 1085 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  30.4 
 
 		 824 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  34.1 
 
 		 1079 aa  215  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 814 aa  211  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 1137 aa  210  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 1064 aa  208  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  31.78 
 
 		 799 aa  207  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  33.44 
 
 		 1076 aa  207  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  34.77 
 
 		 1049 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 1161 aa  205  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  28.06 
 
 		 816 aa  204  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  38.1 
 
 		 776 aa  204  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  32.85 
 
 		 1027 aa  203  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 882 aa  202  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 901 aa  199  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 781 aa  198  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  32.87 
 
 		 678 aa  197  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 1034 aa  197  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  38.33 
 
 		 840 aa  197  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  35.55 
 
 		 972 aa  195  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  37.94 
 
 		 887 aa  195  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  39.28 
 
 		 1141 aa  194  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  30.24 
 
 		 1056 aa  190  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 804 aa  190  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 736 aa  187  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  28.6 
 
 		 1044 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  36.83 
 
 		 921 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  36.44 
 
 		 755 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 831 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  36.22 
 
 		 1119 aa  186  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  38.63 
 
 		 760 aa  183  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 878 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 973 aa  182  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  33.39 
 
 		 630 aa  181  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 966 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.78 
 
 		 964 aa  181  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  31.89 
 
 		 1060 aa  179  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  32.47 
 
 		 630 aa  179  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  32.84 
 
 		 981 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 765 aa  179  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  35.73 
 
 		 779 aa  180  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  34.11 
 
 		 644 aa  178  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  33.59 
 
 		 780 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 		 768 aa  176  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 1071 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  30.45 
 
 		 827 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 		 950 aa  174  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 910 aa  174  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>