More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3609 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
818 aa  1606    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  43.47 
 
 
827 aa  501  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  40.31 
 
 
824 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  39.48 
 
 
886 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  40.05 
 
 
799 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 
840 aa  329  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  34.9 
 
 
792 aa  317  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.28 
 
 
1125 aa  303  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
775 aa  300  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  35.62 
 
 
1092 aa  287  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.18 
 
 
1017 aa  283  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.47 
 
 
999 aa  282  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.64 
 
 
960 aa  282  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 
768 aa  279  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  35.12 
 
 
1103 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.09 
 
 
1102 aa  277  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 
816 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  42.95 
 
 
781 aa  272  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  35 
 
 
1087 aa  268  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  40.05 
 
 
1050 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 
1227 aa  261  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  36.7 
 
 
1119 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 
1058 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
814 aa  250  8e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  38.33 
 
 
1085 aa  250  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 
1049 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 
1042 aa  248  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 
901 aa  247  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  33.82 
 
 
701 aa  245  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  35.27 
 
 
1055 aa  244  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  34.42 
 
 
840 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  40.7 
 
 
765 aa  243  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  39.2 
 
 
1066 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  35.86 
 
 
1056 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  43.65 
 
 
776 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  41.87 
 
 
1137 aa  234  7.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  33.96 
 
 
1093 aa  233  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  31.93 
 
 
1097 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
882 aa  228  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
799 aa  224  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  43.75 
 
 
1060 aa  222  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 
1058 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37.39 
 
 
952 aa  218  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  36.92 
 
 
921 aa  217  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  35.19 
 
 
1100 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  40.64 
 
 
1085 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  40.67 
 
 
1010 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  39.34 
 
 
760 aa  212  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  35.06 
 
 
1036 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 
755 aa  211  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.69 
 
 
916 aa  210  8e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  34.42 
 
 
1072 aa  210  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  33.74 
 
 
780 aa  208  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  40.53 
 
 
887 aa  208  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  32.84 
 
 
957 aa  205  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  39.2 
 
 
1094 aa  204  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  35.28 
 
 
973 aa  204  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  36.07 
 
 
877 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  37.85 
 
 
966 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  33.22 
 
 
1001 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  36.3 
 
 
658 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  34.3 
 
 
969 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  32.95 
 
 
950 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  33.18 
 
 
1110 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  32.87 
 
 
1043 aa  198  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  36.41 
 
 
972 aa  197  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 
798 aa  195  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  35.6 
 
 
601 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  37.98 
 
 
618 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  37.15 
 
 
948 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  31.23 
 
 
961 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  37.46 
 
 
948 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 
1158 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  32.79 
 
 
1048 aa  192  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  32.64 
 
 
907 aa  191  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  38.33 
 
 
973 aa  191  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  26.59 
 
 
975 aa  190  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  34.25 
 
 
678 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 
906 aa  190  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  38.04 
 
 
973 aa  188  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  36.23 
 
 
601 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  36.23 
 
 
601 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  38.51 
 
 
591 aa  187  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  36.59 
 
 
928 aa  187  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  30.19 
 
 
779 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  37.37 
 
 
951 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  36.66 
 
 
931 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  38.51 
 
 
591 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  31.56 
 
 
777 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  34.4 
 
 
490 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  30.26 
 
 
831 aa  181  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  35.31 
 
 
1141 aa  181  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  25.57 
 
 
812 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  37.74 
 
 
418 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 
1014 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 
943 aa  178  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  39.2 
 
 
919 aa  177  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
1082 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  31.67 
 
 
982 aa  177  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>