More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2284 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  100 
 
 		 952 aa  1875    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  55.31 
 
 		 957 aa  907    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.3 
 
 		 960 aa  416  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.43 
 
 		 1092 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 1100 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  41.06 
 
 		 1058 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  40.29 
 
 		 1102 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  39.53 
 
 		 1058 aa  376  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  41.64 
 
 		 1056 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  38.55 
 
 		 1066 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  41.82 
 
 		 1087 aa  366  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  39.26 
 
 		 1042 aa  364  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 1049 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  38.15 
 
 		 1125 aa  356  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  38.05 
 
 		 1050 aa  347  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  39.48 
 
 		 943 aa  336  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  39.93 
 
 		 1093 aa  332  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  38.94 
 
 		 1055 aa  331  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.53 
 
 		 1110 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  39.59 
 
 		 1017 aa  328  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.23 
 
 		 1103 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.02 
 
 		 1097 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  35.31 
 
 		 1043 aa  322  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  39.74 
 
 		 1036 aa  320  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  38.64 
 
 		 1060 aa  318  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  32.96 
 
 		 969 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  38.79 
 
 		 1072 aa  308  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  36.9 
 
 		 1158 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  37.48 
 
 		 1082 aa  305  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  38.54 
 
 		 1048 aa  303  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  38.06 
 
 		 941 aa  298  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 781 aa  295  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  39.15 
 
 		 980 aa  293  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  37.81 
 
 		 963 aa  292  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 1005 aa  289  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  43.58 
 
 		 1085 aa  287  8e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  39.9 
 
 		 701 aa  280  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.09 
 
 		 999 aa  280  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  38.37 
 
 		 1028 aa  277  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  37.59 
 
 		 1094 aa  275  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  34.5 
 
 		 792 aa  274  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  37.33 
 
 		 1018 aa  273  9e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.46 
 
 		 943 aa  271  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 882 aa  267  7e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 1137 aa  263  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  36.9 
 
 		 922 aa  263  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  41.01 
 
 		 760 aa  263  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  33.74 
 
 		 1027 aa  261  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  44.38 
 
 		 887 aa  259  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  35.26 
 
 		 1030 aa  258  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 814 aa  257  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 775 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 1085 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  34.96 
 
 		 630 aa  253  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  39.92 
 
 		 1119 aa  250  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  37.89 
 
 		 921 aa  250  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  41.5 
 
 		 877 aa  249  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 		 816 aa  248  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 765 aa  245  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  34.19 
 
 		 930 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  36.07 
 
 		 919 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  41.12 
 
 		 840 aa  237  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  42.79 
 
 		 601 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  32.63 
 
 		 630 aa  234  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  35.44 
 
 		 824 aa  233  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  41.47 
 
 		 755 aa  233  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  38.25 
 
 		 1186 aa  233  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 393 aa  231  6e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  36.22 
 
 		 799 aa  230  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  36.81 
 
 		 961 aa  230  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  34.82 
 
 		 907 aa  228  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  44.48 
 
 		 878 aa  227  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 921 aa  227  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  39 
 
 		 776 aa  227  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  42 
 
 		 916 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  40.95 
 
 		 1141 aa  225  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  43.02 
 
 		 601 aa  225  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  43.02 
 
 		 601 aa  225  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  36.05 
 
 		 1005 aa  224  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 1227 aa  224  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 591 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  41.08 
 
 		 591 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  32.87 
 
 		 1076 aa  222  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  37.39 
 
 		 818 aa  221  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  33.48 
 
 		 1064 aa  221  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  34.62 
 
 		 964 aa  221  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  36.97 
 
 		 780 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  36.17 
 
 		 678 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 973 aa  218  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  32.46 
 
 		 1131 aa  218  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  41.44 
 
 		 919 aa  217  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 906 aa  216  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 901 aa  216  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.44 
 
 		 966 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 972 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 1034 aa  213  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  32.52 
 
 		 1049 aa  212  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 888 aa  209  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 1001 aa  209  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  33.28 
 
 		 996 aa  209  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>