More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2572 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  55.22 
 
 		 952 aa  892    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 957 aa  1861    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  43.91 
 
 		 1092 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  43.55 
 
 		 1066 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  40.02 
 
 		 960 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  42.78 
 
 		 1102 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  44.12 
 
 		 1110 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  41.43 
 
 		 1125 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  42.08 
 
 		 1017 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  42.96 
 
 		 1056 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 1042 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 1100 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 1058 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  40.38 
 
 		 1050 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  40.58 
 
 		 1158 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 1097 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  42.54 
 
 		 1055 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 969 aa  361  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  41.57 
 
 		 1087 aa  360  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  39.72 
 
 		 1103 aa  360  8e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.05 
 
 		 1058 aa  355  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  39.42 
 
 		 943 aa  351  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  38.43 
 
 		 1043 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  41.26 
 
 		 1036 aa  335  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  41.54 
 
 		 1093 aa  329  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  37.11 
 
 		 1049 aa  324  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 941 aa  323  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  39.18 
 
 		 963 aa  321  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  40.8 
 
 		 1048 aa  317  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  38.73 
 
 		 1005 aa  312  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  41.72 
 
 		 1060 aa  311  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  40.54 
 
 		 1072 aa  310  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  40.69 
 
 		 1094 aa  299  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  40.24 
 
 		 1028 aa  296  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  36.06 
 
 		 792 aa  295  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  39.09 
 
 		 980 aa  291  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 1082 aa  290  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  39.69 
 
 		 922 aa  290  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 943 aa  281  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  38.05 
 
 		 1018 aa  280  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 781 aa  275  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  40.8 
 
 		 1085 aa  273  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  44.27 
 
 		 1186 aa  273  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.69 
 
 		 999 aa  262  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  42.3 
 
 		 882 aa  252  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  36.47 
 
 		 701 aa  253  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 887 aa  251  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 1005 aa  244  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 1137 aa  244  7e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 1085 aa  243  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 755 aa  241  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  41.16 
 
 		 1119 aa  237  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  34.42 
 
 		 824 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  33.39 
 
 		 775 aa  233  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  33.26 
 
 		 816 aa  230  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  38.37 
 
 		 972 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  36.34 
 
 		 765 aa  225  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  35.54 
 
 		 1064 aa  225  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 814 aa  224  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  33.59 
 
 		 799 aa  224  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  41.15 
 
 		 840 aa  224  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  37.5 
 
 		 760 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 654 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  42.07 
 
 		 916 aa  222  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  36.85 
 
 		 1131 aa  221  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  41.71 
 
 		 878 aa  220  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 393 aa  219  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 1049 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  43.09 
 
 		 919 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  40.36 
 
 		 780 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  39.9 
 
 		 1227 aa  215  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.64 
 
 		 877 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  31.42 
 
 		 776 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  34.07 
 
 		 1076 aa  210  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  32.6 
 
 		 992 aa  210  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  34 
 
 		 928 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  35.61 
 
 		 678 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.23 
 
 		 981 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  41.34 
 
 		 982 aa  209  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  37.24 
 
 		 886 aa  209  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 901 aa  209  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  37.96 
 
 		 907 aa  208  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  33 
 
 		 630 aa  207  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  37.37 
 
 		 1141 aa  207  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  32.27 
 
 		 983 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  39.9 
 
 		 601 aa  207  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  36.6 
 
 		 961 aa  206  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  32.8 
 
 		 934 aa  206  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 921 aa  205  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  33.61 
 
 		 768 aa  205  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  40.8 
 
 		 591 aa  204  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  40.1 
 
 		 591 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  40.05 
 
 		 601 aa  201  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  40.05 
 
 		 601 aa  201  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  35.94 
 
 		 950 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 1001 aa  199  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 906 aa  198  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  36.8 
 
 		 973 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  36.05 
 
 		 818 aa  197  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  31.52 
 
 		 1108 aa  197  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>