More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5260 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 1093 aa  2089    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  42.44 
 
 		 1100 aa  632  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 1082 aa  586  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  42.63 
 
 		 1056 aa  582  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  39.78 
 
 		 1050 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  42.54 
 
 		 1072 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  39.7 
 
 		 1043 aa  535  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  40.6 
 
 		 1087 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 1058 aa  520  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  38.82 
 
 		 1049 aa  519  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  37.86 
 
 		 1042 aa  509  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  40.22 
 
 		 1058 aa  506  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  38.11 
 
 		 1097 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  39.08 
 
 		 1048 aa  491  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  38.68 
 
 		 1066 aa  485  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  42.42 
 
 		 1110 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  39.89 
 
 		 1060 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 1028 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  40.07 
 
 		 1005 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  38.2 
 
 		 1036 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.77 
 
 		 1092 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.66 
 
 		 1102 aa  429  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.56 
 
 		 1103 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.12 
 
 		 1125 aa  426  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  38.9 
 
 		 1094 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.4 
 
 		 1017 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  39.39 
 
 		 1055 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  40.43 
 
 		 960 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  36.4 
 
 		 1158 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.55 
 
 		 957 aa  351  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  51.95 
 
 		 1186 aa  347  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  39.54 
 
 		 969 aa  338  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37.77 
 
 		 952 aa  335  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 		 922 aa  326  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  37.64 
 
 		 1018 aa  325  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.58 
 
 		 999 aa  317  7e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  40.1 
 
 		 1064 aa  310  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  37.63 
 
 		 1131 aa  300  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 1076 aa  287  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  38.15 
 
 		 943 aa  287  9e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  36.9 
 
 		 1227 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  38.08 
 
 		 792 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  35.28 
 
 		 1049 aa  274  5.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  38 
 
 		 701 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  34.75 
 
 		 824 aa  267  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  41.9 
 
 		 1085 aa  266  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  37.08 
 
 		 1005 aa  264  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  43.23 
 
 		 840 aa  264  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  33.4 
 
 		 1079 aa  261  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 781 aa  260  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 943 aa  258  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 1034 aa  257  9e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 1137 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 775 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  34.68 
 
 		 799 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 1100 aa  253  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  36.3 
 
 		 963 aa  247  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 980 aa  247  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  37.02 
 
 		 941 aa  244  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 755 aa  244  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.23 
 
 		 816 aa  242  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  42 
 
 		 760 aa  241  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  42.49 
 
 		 887 aa  240  9e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  36.83 
 
 		 1161 aa  240  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  42.61 
 
 		 972 aa  239  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  39.95 
 
 		 776 aa  237  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  33.79 
 
 		 1060 aa  237  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  41.03 
 
 		 1119 aa  237  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  35.1 
 
 		 886 aa  237  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  45.36 
 
 		 765 aa  235  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  39.26 
 
 		 678 aa  234  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 1085 aa  231  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  42.21 
 
 		 973 aa  231  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  34.07 
 
 		 818 aa  229  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  32.93 
 
 		 1056 aa  229  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  43.09 
 
 		 973 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 973 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  41.05 
 
 		 966 aa  226  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  38.38 
 
 		 921 aa  226  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 814 aa  225  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  40.86 
 
 		 1010 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  38.97 
 
 		 1014 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  42.46 
 
 		 948 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 882 aa  219  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  42.18 
 
 		 948 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 950 aa  218  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  44.66 
 
 		 601 aa  218  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  44.66 
 
 		 601 aa  218  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  44.11 
 
 		 601 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 901 aa  216  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 393 aa  216  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  40.29 
 
 		 916 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  35.91 
 
 		 827 aa  213  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  43.92 
 
 		 931 aa  213  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 1001 aa  213  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  40.06 
 
 		 877 aa  211  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  43.58 
 
 		 951 aa  211  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  42 
 
 		 591 aa  211  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  44.01 
 
 		 591 aa  211  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 1064 aa  210  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>