More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5030 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 
1056 aa  2119    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  29.81 
 
 
999 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  29.55 
 
 
816 aa  263  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  29.99 
 
 
901 aa  256  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  31.17 
 
 
792 aa  251  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
781 aa  248  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
799 aa  239  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  31.94 
 
 
888 aa  237  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  29.78 
 
 
1125 aa  235  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  30.32 
 
 
910 aa  233  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  29.77 
 
 
975 aa  230  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  32.27 
 
 
1102 aa  227  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
729 aa  222  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  29.81 
 
 
824 aa  221  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  28.34 
 
 
960 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  30.89 
 
 
768 aa  216  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  31.4 
 
 
1100 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  32.55 
 
 
814 aa  214  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
726 aa  214  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  30.34 
 
 
1058 aa  214  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  31.76 
 
 
1227 aa  214  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  31.84 
 
 
1055 aa  212  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
736 aa  211  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  29.39 
 
 
952 aa  211  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  29.65 
 
 
797 aa  211  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 
812 aa  210  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  32.34 
 
 
1110 aa  208  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  35.52 
 
 
916 aa  208  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 
1097 aa  208  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  32.93 
 
 
1093 aa  208  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  34.69 
 
 
701 aa  208  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  34.52 
 
 
1119 aa  208  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  29.9 
 
 
1049 aa  207  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  28.5 
 
 
1092 aa  207  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
775 aa  206  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  31.27 
 
 
1064 aa  206  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
882 aa  205  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  29.51 
 
 
1066 aa  205  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  28.96 
 
 
1050 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  32.04 
 
 
1085 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  29.74 
 
 
1042 aa  202  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  35.84 
 
 
755 aa  202  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  30.09 
 
 
886 aa  202  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  30.42 
 
 
1044 aa  201  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
1137 aa  200  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  37.24 
 
 
840 aa  200  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  29.01 
 
 
957 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  36.98 
 
 
887 aa  198  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  31.38 
 
 
1103 aa  197  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  29.99 
 
 
1087 aa  197  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  32.19 
 
 
831 aa  196  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  37.95 
 
 
972 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  29.26 
 
 
996 aa  192  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  29.89 
 
 
1043 aa  191  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  30.58 
 
 
1056 aa  190  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  32.59 
 
 
1005 aa  190  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
798 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  28.59 
 
 
872 aa  185  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  32.14 
 
 
678 aa  185  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  35.59 
 
 
966 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  31.42 
 
 
779 aa  184  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  36.11 
 
 
601 aa  183  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  26.27 
 
 
1050 aa  182  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  30.1 
 
 
1017 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  36.21 
 
 
877 aa  181  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  32.87 
 
 
776 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  30.1 
 
 
1131 aa  180  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  31.37 
 
 
1036 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  30.24 
 
 
1018 aa  177  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  25.5 
 
 
802 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  32.02 
 
 
950 aa  176  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  30.91 
 
 
1072 aa  176  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  31.66 
 
 
943 aa  176  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  31.98 
 
 
922 aa  175  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  38.29 
 
 
973 aa  173  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  26.82 
 
 
992 aa  172  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  34.76 
 
 
1058 aa  171  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  33.13 
 
 
765 aa  171  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  38.02 
 
 
973 aa  171  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  35.9 
 
 
601 aa  171  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  35.9 
 
 
601 aa  171  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  29.13 
 
 
1064 aa  170  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  30.31 
 
 
804 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 
921 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  26.37 
 
 
991 aa  167  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
1085 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  38.83 
 
 
948 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  37.3 
 
 
948 aa  163  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  32.34 
 
 
760 aa  160  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  29.37 
 
 
1145 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
1082 aa  157  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  28.32 
 
 
956 aa  157  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  36.41 
 
 
1014 aa  157  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  36.75 
 
 
618 aa  156  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  30.44 
 
 
777 aa  156  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  33.12 
 
 
644 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  31.07 
 
 
1060 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  30.89 
 
 
780 aa  155  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 
878 aa  155  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.55 
 
 
1104 aa  154  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>