More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3711 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 765 aa  1513    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  39.87 
 
 		 792 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 775 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 814 aa  349  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  34.94 
 
 		 824 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  38.41 
 
 		 755 aa  328  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  38.46 
 
 		 960 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 781 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  34.54 
 
 		 776 aa  303  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  39.45 
 
 		 701 aa  303  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  41.04 
 
 		 1119 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 1085 aa  291  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  36.86 
 
 		 1085 aa  290  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 1137 aa  289  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.6 
 
 		 816 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  34.59 
 
 		 768 aa  284  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.75 
 
 		 999 aa  284  5.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 886 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.02 
 
 		 1092 aa  274  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  32.13 
 
 		 799 aa  272  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  41 
 
 		 760 aa  272  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  48.61 
 
 		 1087 aa  272  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37 
 
 		 1017 aa  271  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  34.16 
 
 		 1125 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  37.47 
 
 		 1058 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.62 
 
 		 1102 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 1066 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  34.55 
 
 		 840 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  40.8 
 
 		 1050 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 1049 aa  260  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  35.73 
 
 		 916 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 1042 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 882 aa  257  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 887 aa  254  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  40.92 
 
 		 1100 aa  254  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  41.36 
 
 		 818 aa  251  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  41.16 
 
 		 1056 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 1093 aa  247  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.58 
 
 		 1058 aa  247  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  34.24 
 
 		 780 aa  246  9e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  33.67 
 
 		 678 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  40.09 
 
 		 952 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.62 
 
 		 1055 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  32.61 
 
 		 1103 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 1010 aa  237  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  37.47 
 
 		 957 aa  236  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  43.63 
 
 		 1227 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  42.31 
 
 		 1097 aa  233  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.86 
 
 		 1110 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  36.26 
 
 		 921 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 1082 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  46.59 
 
 		 969 aa  229  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  39.14 
 
 		 1072 aa  228  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 1043 aa  228  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  35.67 
 
 		 950 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  38.59 
 
 		 961 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  38.37 
 
 		 1036 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 888 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 1094 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  39.88 
 
 		 950 aa  221  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  41.64 
 
 		 1001 aa  220  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 393 aa  220  7.999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  37.81 
 
 		 1060 aa  219  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  41.57 
 
 		 972 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  38.66 
 
 		 877 aa  217  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  43.47 
 
 		 418 aa  217  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  39.72 
 
 		 490 aa  217  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  39.43 
 
 		 966 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  44.28 
 
 		 601 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  39.88 
 
 		 928 aa  214  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  41.06 
 
 		 878 aa  213  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  37.19 
 
 		 827 aa  213  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 799 aa  213  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  35.09 
 
 		 943 aa  212  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  38.25 
 
 		 973 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  44.57 
 
 		 601 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  41.37 
 
 		 591 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  44.57 
 
 		 601 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  41.05 
 
 		 591 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  35.46 
 
 		 658 aa  206  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  36.02 
 
 		 922 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 959 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  33.49 
 
 		 982 aa  204  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  41.84 
 
 		 948 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  39.57 
 
 		 1048 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 910 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 		 975 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 956 aa  202  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  35.36 
 
 		 907 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 1141 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 901 aa  200  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  30.78 
 
 		 953 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  43.82 
 
 		 1158 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  41.81 
 
 		 919 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  38.61 
 
 		 938 aa  195  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  37.91 
 
 		 1014 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  38.74 
 
 		 973 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  29.86 
 
 		 777 aa  194  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  38.92 
 
 		 973 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  33.2 
 
 		 779 aa  193  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>