More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0444 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 938 aa  1782    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 919 aa  472  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3572  transcriptional regulator, LuxR family  40.57 
 
 		 914 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  35.15 
 
 		 931 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  34.65 
 
 		 951 aa  291  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2078  transcriptional regulator, LuxR family  35.49 
 
 		 940 aa  271  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.9735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.06 
 
 		 1085 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  44.51 
 
 		 755 aa  209  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  43.95 
 
 		 840 aa  204  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  41.42 
 
 		 887 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 1137 aa  196  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  41.22 
 
 		 1119 aa  192  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 775 aa  189  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 882 aa  189  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  39.09 
 
 		 1056 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 393 aa  189  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  37.4 
 
 		 792 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  40.76 
 
 		 779 aa  187  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  38.37 
 
 		 765 aa  187  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  40.38 
 
 		 960 aa  187  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 781 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.27 
 
 		 916 aa  183  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  38.28 
 
 		 1125 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  40.86 
 
 		 1066 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 943 aa  181  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.7 
 
 		 1110 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  36.79 
 
 		 1042 aa  180  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  40.44 
 
 		 1102 aa  179  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  39.58 
 
 		 1087 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 1227 aa  178  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  38.44 
 
 		 957 aa  177  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  37.68 
 
 		 701 aa  177  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 1097 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  37.11 
 
 		 1058 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  40.54 
 
 		 678 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 1085 aa  175  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  37.14 
 
 		 1049 aa  175  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  39.3 
 
 		 886 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 1058 aa  174  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  37.57 
 
 		 824 aa  174  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  37.5 
 
 		 776 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 928 aa  171  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 		 816 aa  169  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  42.04 
 
 		 1018 aa  169  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.65 
 
 		 827 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.16 
 
 		 1092 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.91 
 
 		 1017 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 1082 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  40.22 
 
 		 1094 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  36.93 
 
 		 1072 aa  166  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 950 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 768 aa  165  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  39.24 
 
 		 1093 aa  164  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 952 aa  164  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  36.8 
 
 		 490 aa  163  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 972 aa  163  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  39.87 
 
 		 878 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  37.72 
 
 		 601 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.39 
 
 		 760 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  34.26 
 
 		 1050 aa  161  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  38.56 
 
 		 1055 aa  161  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 1100 aa  161  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 		 969 aa  161  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 888 aa  160  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 812 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 601 aa  160  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 601 aa  160  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  36.1 
 
 		 1141 aa  159  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 831 aa  159  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.38 
 
 		 999 aa  158  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  36.98 
 
 		 877 aa  158  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  37.6 
 
 		 980 aa  158  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 921 aa  158  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  32.22 
 
 		 950 aa  157  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 814 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  35.07 
 
 		 959 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  38.26 
 
 		 1036 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  35.75 
 
 		 1043 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  37.64 
 
 		 1079 aa  154  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 973 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 901 aa  153  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 		 1049 aa  152  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 973 aa  151  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  37.9 
 
 		 1060 aa  151  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 1076 aa  150  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  38.19 
 
 		 644 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 618 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  34.47 
 
 		 1014 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  35.66 
 
 		 1064 aa  150  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  39.94 
 
 		 1158 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  34.46 
 
 		 777 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 941 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  37.01 
 
 		 948 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 948 aa  148  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 973 aa  147  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  35.71 
 
 		 1103 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 954 aa  147  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  38.7 
 
 		 963 aa  146  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  38.56 
 
 		 418 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 1161 aa  144  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>