More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3572 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3572  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 914 aa  1778    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  47.16 
 
 		 919 aa  644    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  41.37 
 
 		 938 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  36.43 
 
 		 951 aa  334  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  35.5 
 
 		 931 aa  318  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2078  transcriptional regulator, LuxR family  35.42 
 
 		 940 aa  281  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.9735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  39.57 
 
 		 1085 aa  221  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 1137 aa  205  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  39.7 
 
 		 887 aa  198  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 393 aa  197  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  38.43 
 
 		 1087 aa  197  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  38.16 
 
 		 824 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  39.72 
 
 		 1036 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 882 aa  194  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  40.59 
 
 		 1056 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  33.69 
 
 		 960 aa  189  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  33.2 
 
 		 950 aa  188  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  32.64 
 
 		 921 aa  187  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  38.79 
 
 		 877 aa  187  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  39.15 
 
 		 1141 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 972 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 775 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 1042 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  37.5 
 
 		 1119 aa  184  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  41.92 
 
 		 1110 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  36.79 
 
 		 1227 aa  181  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  41.39 
 
 		 980 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  38.69 
 
 		 943 aa  181  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  39.25 
 
 		 952 aa  181  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 961 aa  180  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  34.34 
 
 		 1050 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.54 
 
 		 1125 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  36.4 
 
 		 1060 aa  179  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  36.63 
 
 		 755 aa  178  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37 
 
 		 1102 aa  177  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.78 
 
 		 1058 aa  177  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  40.12 
 
 		 953 aa  177  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  34.72 
 
 		 1058 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  38.43 
 
 		 1055 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.12 
 
 		 957 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  33.8 
 
 		 701 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  37.79 
 
 		 886 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 781 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  34.66 
 
 		 768 aa  174  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  35.43 
 
 		 928 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 779 aa  174  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  35.24 
 
 		 1092 aa  174  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 1066 aa  174  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  33.33 
 
 		 678 aa  174  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  35.81 
 
 		 777 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  36.96 
 
 		 840 aa  173  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  40.12 
 
 		 878 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  35.47 
 
 		 792 aa  173  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 1085 aa  171  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  34.7 
 
 		 760 aa  172  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  35.54 
 
 		 959 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 814 aa  169  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  36.68 
 
 		 1049 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.3 
 
 		 1017 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  36.71 
 
 		 1072 aa  168  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.41 
 
 		 827 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  31.87 
 
 		 776 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  39.64 
 
 		 1018 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 812 aa  166  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  37.75 
 
 		 799 aa  164  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.02 
 
 		 816 aa  164  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 973 aa  164  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 1010 aa  163  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 950 aa  161  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  38.44 
 
 		 1076 aa  161  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  34.99 
 
 		 601 aa  161  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  38.42 
 
 		 1094 aa  160  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 954 aa  160  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  33.79 
 
 		 765 aa  160  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.15 
 
 		 999 aa  160  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  34.99 
 
 		 601 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  34.99 
 
 		 601 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  38.27 
 
 		 916 aa  159  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 966 aa  158  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  41.61 
 
 		 941 aa  158  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  35.77 
 
 		 1097 aa  158  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  35.54 
 
 		 818 aa  158  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 948 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 1001 aa  157  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 591 aa  157  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 948 aa  157  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 418 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  35.49 
 
 		 1064 aa  156  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  33.81 
 
 		 591 aa  156  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 831 aa  155  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0128  transcriptional regulator  40.88 
 
 		 695 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  33.83 
 
 		 1103 aa  154  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  31.04 
 
 		 888 aa  154  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  34.76 
 
 		 973 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 1060 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 1043 aa  152  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  34.47 
 
 		 973 aa  152  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  38.48 
 
 		 1049 aa  152  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 736 aa  152  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  33.58 
 
 		 1131 aa  150  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>