More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0684 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 779 aa  1516    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 910 aa  294  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 816 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 812 aa  265  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  30.78 
 
 		 901 aa  248  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  35.36 
 
 		 768 aa  237  8e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 888 aa  235  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 726 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.24 
 
 		 999 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  38.95 
 
 		 1087 aa  231  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 831 aa  227  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 781 aa  226  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.85 
 
 		 1125 aa  226  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 		 1058 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  39.18 
 
 		 1102 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 804 aa  220  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 1082 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  38.58 
 
 		 1056 aa  218  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  36.38 
 
 		 1085 aa  216  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 1066 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  39.33 
 
 		 916 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  34.27 
 
 		 886 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  33.99 
 
 		 961 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  38.91 
 
 		 1072 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  36.49 
 
 		 792 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  33.26 
 
 		 701 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 802 aa  210  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.59 
 
 		 1227 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.44 
 
 		 960 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  28.82 
 
 		 975 aa  209  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  33.89 
 
 		 799 aa  207  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  34.93 
 
 		 1049 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  35.03 
 
 		 1050 aa  207  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  34.32 
 
 		 1100 aa  206  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 798 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.34 
 
 		 1043 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  37.45 
 
 		 840 aa  204  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  29.92 
 
 		 824 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 799 aa  201  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  35.45 
 
 		 1103 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  36.53 
 
 		 1042 aa  200  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.41 
 
 		 1110 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 872 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 775 aa  198  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 1137 aa  197  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 1094 aa  197  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  36.16 
 
 		 972 aa  195  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.42 
 
 		 1017 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  33.68 
 
 		 1092 aa  194  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  38.04 
 
 		 1119 aa  194  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  37.01 
 
 		 957 aa  192  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 1085 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.5 
 
 		 969 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 921 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  34.25 
 
 		 776 aa  190  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  32.81 
 
 		 950 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  31.2 
 
 		 907 aa  188  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  35.06 
 
 		 765 aa  187  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 938 aa  187  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 736 aa  187  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  37.37 
 
 		 1010 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  29.5 
 
 		 818 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  39.36 
 
 		 1055 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  33.79 
 
 		 928 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.47 
 
 		 1097 aa  184  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  40.18 
 
 		 887 aa  182  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.03 
 
 		 1036 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 882 aa  181  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  35.08 
 
 		 1005 aa  181  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  31.24 
 
 		 797 aa  180  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  34.39 
 
 		 1060 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  35.5 
 
 		 952 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  30.69 
 
 		 982 aa  179  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  35.01 
 
 		 950 aa  178  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  37.27 
 
 		 755 aa  178  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  31.05 
 
 		 1056 aa  177  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  29.99 
 
 		 996 aa  177  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  38.25 
 
 		 919 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 1005 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  33.93 
 
 		 1093 aa  177  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 1001 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 658 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  35.46 
 
 		 1018 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  33.49 
 
 		 780 aa  174  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  36.66 
 
 		 973 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 931 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 490 aa  170  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 877 aa  170  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 729 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  36.12 
 
 		 973 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  33.41 
 
 		 973 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  32.1 
 
 		 1058 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  36.31 
 
 		 948 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 814 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  28.12 
 
 		 991 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 922 aa  164  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  33.12 
 
 		 966 aa  164  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 959 aa  161  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 618 aa  161  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.79 
 
 		 827 aa  160  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>