More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2832 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1145 aa  2330    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  36.31 
 
 		 1044 aa  303  9e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 1064 aa  303  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  28.6 
 
 		 991 aa  288  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  26.9 
 
 		 996 aa  186  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  27.28 
 
 		 999 aa  178  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  25.03 
 
 		 992 aa  166  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 1050 aa  166  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  27.71 
 
 		 1058 aa  163  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  25.92 
 
 		 1017 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  26.04 
 
 		 1125 aa  153  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  28.62 
 
 		 1042 aa  151  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  25.84 
 
 		 1087 aa  150  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.37 
 
 		 1056 aa  149  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  26.8 
 
 		 1055 aa  148  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  27.71 
 
 		 957 aa  147  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  27.72 
 
 		 1050 aa  146  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  30.11 
 
 		 960 aa  144  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  25.97 
 
 		 1092 aa  144  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  27.03 
 
 		 1064 aa  144  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  26.39 
 
 		 1227 aa  138  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 901 aa  137  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  32.3 
 
 		 916 aa  137  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  29.57 
 
 		 1100 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  27.52 
 
 		 943 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.96 
 
 		 1104 aa  135  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  27.21 
 
 		 1049 aa  135  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 888 aa  135  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  28.18 
 
 		 1110 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  27.12 
 
 		 816 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  32.35 
 
 		 1036 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  26.46 
 
 		 1102 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  27.81 
 
 		 1058 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  29.7 
 
 		 1093 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  27.1 
 
 		 1018 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  29.56 
 
 		 1131 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  32.98 
 
 		 840 aa  128  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  25.8 
 
 		 1103 aa  128  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  27.92 
 
 		 1066 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  28.22 
 
 		 827 aa  126  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  30.14 
 
 		 630 aa  126  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 1082 aa  127  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  24.57 
 
 		 981 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  31.64 
 
 		 779 aa  125  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 952 aa  125  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  29.51 
 
 		 1072 aa  124  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  35.03 
 
 		 818 aa  124  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  27.83 
 
 		 922 aa  123  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  33.12 
 
 		 943 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  28.89 
 
 		 768 aa  122  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 831 aa  120  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  28.68 
 
 		 630 aa  118  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  25.63 
 
 		 1097 aa  118  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  25.6 
 
 		 824 aa  118  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  28.13 
 
 		 1056 aa  118  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  28.99 
 
 		 1141 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  33.45 
 
 		 973 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  32.55 
 
 		 948 aa  115  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  33.11 
 
 		 973 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 1158 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 812 aa  112  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  27.36 
 
 		 1100 aa  111  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  28.35 
 
 		 701 aa  111  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 804 aa  111  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 948 aa  111  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 502 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  33.11 
 
 		 886 aa  110  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 963 aa  109  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  29.84 
 
 		 792 aa  108  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 775 aa  108  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  27.69 
 
 		 921 aa  108  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  31.51 
 
 		 755 aa  107  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 802 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  31.97 
 
 		 490 aa  106  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  27.32 
 
 		 1085 aa  105  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 973 aa  105  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  28.95 
 
 		 961 aa  105  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 765 aa  105  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  27.34 
 
 		 941 aa  105  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 872 aa  105  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 922 aa  104  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  27.05 
 
 		 969 aa  104  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  27.55 
 
 		 950 aa  104  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  31.25 
 
 		 1055 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 910 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  28.88 
 
 		 959 aa  102  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  29.32 
 
 		 956 aa  102  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  32.48 
 
 		 1013 aa  102  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 418 aa  102  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  30.46 
 
 		 878 aa  101  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  30.47 
 
 		 938 aa  101  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  30.87 
 
 		 777 aa  101  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  29.34 
 
 		 928 aa  100  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  32.47 
 
 		 1060 aa  100  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  31.17 
 
 		 931 aa  99.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  26.7 
 
 		 930 aa  99.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 798 aa  99  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.06 
 
 		 1029 aa  98.6  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  25.6 
 
 		 1043 aa  98.6  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  26.74 
 
 		 1094 aa  98.2  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>