More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2548 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 992 aa  1947    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 1064 aa  344  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  32.36 
 
 		 1044 aa  317  9e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  29.35 
 
 		 996 aa  270  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 1050 aa  264  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  27.99 
 
 		 991 aa  262  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  31.04 
 
 		 999 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.89 
 
 		 1104 aa  214  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  29.9 
 
 		 1092 aa  208  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  27.86 
 
 		 816 aa  201  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  29.09 
 
 		 1049 aa  188  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 729 aa  186  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  26.35 
 
 		 1145 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 888 aa  184  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  28.63 
 
 		 975 aa  184  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 799 aa  183  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  27.81 
 
 		 1056 aa  181  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 872 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 901 aa  179  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 910 aa  177  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  28.7 
 
 		 799 aa  173  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  29.24 
 
 		 1125 aa  173  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  27.43 
 
 		 1097 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  30.79 
 
 		 1227 aa  171  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  29.31 
 
 		 1017 aa  167  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 736 aa  166  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  28.35 
 
 		 1102 aa  165  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 812 aa  165  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  28.99 
 
 		 1055 aa  164  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  31 
 
 		 768 aa  161  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  28.99 
 
 		 1056 aa  161  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  27.76 
 
 		 1110 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  29.86 
 
 		 1119 aa  156  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  28.25 
 
 		 957 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 726 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 798 aa  153  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  29.02 
 
 		 1103 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  28.72 
 
 		 1066 aa  152  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  28.21 
 
 		 824 aa  152  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  32.84 
 
 		 1036 aa  151  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  30.77 
 
 		 916 aa  151  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  30.81 
 
 		 779 aa  149  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  27.1 
 
 		 1050 aa  149  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  29.98 
 
 		 797 aa  147  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  30.17 
 
 		 792 aa  144  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.17 
 
 		 827 aa  142  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  26.84 
 
 		 1018 aa  142  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  30.34 
 
 		 969 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 831 aa  142  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 781 aa  141  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  27.71 
 
 		 1072 aa  141  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  26.94 
 
 		 1087 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  29.3 
 
 		 952 aa  140  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 886 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  29.92 
 
 		 943 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  26.21 
 
 		 1058 aa  140  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  30.63 
 
 		 840 aa  140  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  29.92 
 
 		 1085 aa  138  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  27.12 
 
 		 1058 aa  137  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  31.67 
 
 		 1093 aa  138  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  28.14 
 
 		 1064 aa  134  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  29.02 
 
 		 922 aa  134  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 1085 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 775 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  35.24 
 
 		 972 aa  132  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  28.52 
 
 		 1042 aa  131  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 630 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  27.09 
 
 		 921 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 928 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  32.67 
 
 		 1100 aa  127  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  31.72 
 
 		 960 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  27.78 
 
 		 1060 aa  125  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  36.29 
 
 		 919 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  27.26 
 
 		 961 aa  125  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  29.48 
 
 		 1043 aa  125  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  30.35 
 
 		 630 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 882 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  30.8 
 
 		 1049 aa  123  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  29.32 
 
 		 818 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  37.07 
 
 		 1139 aa  122  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  29.21 
 
 		 1131 aa  122  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 877 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  36.72 
 
 		 765 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  34.47 
 
 		 887 aa  122  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  26.65 
 
 		 701 aa  122  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  26.19 
 
 		 780 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  33.56 
 
 		 1034 aa  121  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  27.65 
 
 		 1100 aa  122  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 959 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  28.55 
 
 		 950 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  31.92 
 
 		 950 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 814 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  32.28 
 
 		 1029 aa  119  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 1082 aa  118  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  30.22 
 
 		 1076 aa  118  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  29.79 
 
 		 782 aa  117  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1062  transcriptional regulator, LuxR family  33.86 
 
 		 933 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  28.86 
 
 		 1060 aa  116  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  29.57 
 
 		 943 aa  115  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  26.62 
 
 		 963 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>