More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2154 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  100 
 
 		 1139 aa  2211    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 1089 aa  881    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  38.63 
 
 		 1163 aa  345  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.9 
 
 		 1029 aa  201  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  29.85 
 
 		 1143 aa  184  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.76 
 
 		 1067 aa  172  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.29 
 
 		 1055 aa  167  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27.25 
 
 		 1034 aa  148  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.02 
 
 		 1126 aa  145  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  27.77 
 
 		 1013 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  27.79 
 
 		 713 aa  142  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  29.69 
 
 		 494 aa  129  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  25.54 
 
 		 1083 aa  127  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 648 aa  116  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  27.22 
 
 		 647 aa  114  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  27.22 
 
 		 647 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  37.07 
 
 		 992 aa  108  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 1064 aa  106  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  32.04 
 
 		 1044 aa  104  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  26 
 
 		 1193 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  25.82 
 
 		 1190 aa  101  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  21.88 
 
 		 1826 aa  99.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  24.65 
 
 		 1183 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 1116 aa  97.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  30.39 
 
 		 966 aa  95.9  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 		 1403 aa  94  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 1216 aa  94.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  26.71 
 
 		 1142 aa  92  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  26.48 
 
 		 1075 aa  92  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 1050 aa  91.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  31.19 
 
 		 996 aa  91.7  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.22 
 
 		 1080 aa  90.9  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  25.95 
 
 		 1109 aa  88.6  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  25.8 
 
 		 1122 aa  87.4  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  24.58 
 
 		 1134 aa  86.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 1217 aa  85.9  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.28 
 
 		 1081 aa  85.1  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  27.76 
 
 		 1007 aa  84.7  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.17 
 
 		 954 aa  84.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.51 
 
 		 1291 aa  84.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  26.72 
 
 		 900 aa  82.8  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  26.47 
 
 		 1118 aa  83.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  27.5 
 
 		 992 aa  83.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  26.47 
 
 		 1118 aa  82.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  27.66 
 
 		 998 aa  81.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  28.69 
 
 		 1056 aa  80.9  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  29.74 
 
 		 549 aa  80.5  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  22.98 
 
 		 2279 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  30.66 
 
 		 981 aa  80.1  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 1118 aa  80.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 1015 aa  79.3  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  27.11 
 
 		 1022 aa  79.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  30.6 
 
 		 999 aa  78.2  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  28.81 
 
 		 1090 aa  77.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  24.7 
 
 		 1050 aa  75.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.7 
 
 		 1050 aa  75.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  26.19 
 
 		 956 aa  75.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  28.77 
 
 		 1145 aa  74.7  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  30.85 
 
 		 1118 aa  74.7  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.03 
 
 		 1117 aa  74.3  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  25.53 
 
 		 1094 aa  74.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.66 
 
 		 1141 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  25.84 
 
 		 1160 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.12 
 
 		 1774 aa  73.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25.57 
 
 		 1227 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.17 
 
 		 1805 aa  72.8  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.12 
 
 		 1020 aa  73.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  29.26 
 
 		 948 aa  73.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  28.37 
 
 		 871 aa  72.4  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  30.94 
 
 		 1163 aa  72.4  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  29.72 
 
 		 947 aa  72.4  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  28.19 
 
 		 953 aa  72  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0233  transcriptional regulator, SARP family  27.14 
 
 		 911 aa  71.6  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  24.14 
 
 		 1105 aa  71.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  25.63 
 
 		 1084 aa  71.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  24.78 
 
 		 1402 aa  71.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  22.98 
 
 		 2303 aa  71.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.88 
 
 		 1014 aa  71.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  28.1 
 
 		 1150 aa  70.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  23.22 
 
 		 1123 aa  71.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 636 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  30.93 
 
 		 261 aa  71.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 		 1063 aa  70.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  26.25 
 
 		 1133 aa  70.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  23.59 
 
 		 1148 aa  70.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  28.21 
 
 		 867 aa  69.7  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.53 
 
 		 1780 aa  69.7  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 1914 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 872 aa  69.3  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.89 
 
 		 1055 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.02 
 
 		 1804 aa  68.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  25.42 
 
 		 1048 aa  68.6  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.58 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  28.83 
 
 		 963 aa  68.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  24.26 
 
 		 2272 aa  68.2  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  26.08 
 
 		 2109 aa  68.2  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 		 852 aa  67.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  31.78 
 
 		 650 aa  67.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 		 1398 aa  67.4  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.44 
 
 		 1089 aa  67.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>