More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1461 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 950 aa  1782    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  36.94 
 
 		 1022 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  34.78 
 
 		 1108 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  36.45 
 
 		 1021 aa  428  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  37.19 
 
 		 971 aa  429  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  37.62 
 
 		 954 aa  412  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  36.99 
 
 		 1025 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 654 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  36.89 
 
 		 992 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  36.3 
 
 		 990 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  38.02 
 
 		 1088 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  34.49 
 
 		 934 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.84 
 
 		 940 aa  365  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  34.75 
 
 		 1020 aa  365  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  36.41 
 
 		 931 aa  360  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.32 
 
 		 921 aa  359  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  33.64 
 
 		 981 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 1071 aa  357  5.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  33.68 
 
 		 996 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 1346 aa  351  5e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 1319 aa  350  6e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  35.65 
 
 		 992 aa  350  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.88 
 
 		 1025 aa  346  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  41.91 
 
 		 1030 aa  343  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  38.9 
 
 		 775 aa  337  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  37.85 
 
 		 621 aa  337  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  36.42 
 
 		 965 aa  336  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  33.02 
 
 		 946 aa  332  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  40.36 
 
 		 1003 aa  330  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.45 
 
 		 1017 aa  329  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 		 964 aa  324  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  32.84 
 
 		 913 aa  321  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  35.43 
 
 		 930 aa  320  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.72 
 
 		 1013 aa  321  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  39.82 
 
 		 935 aa  317  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  37.82 
 
 		 1014 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  35.14 
 
 		 965 aa  315  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  39.3 
 
 		 1010 aa  308  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  34.17 
 
 		 919 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  41.79 
 
 		 1138 aa  305  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  38.06 
 
 		 990 aa  303  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 1048 aa  302  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  31.66 
 
 		 941 aa  300  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  33.13 
 
 		 1022 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  36.05 
 
 		 995 aa  296  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  34.11 
 
 		 956 aa  295  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  31.01 
 
 		 1003 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  29.91 
 
 		 1027 aa  291  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.26 
 
 		 921 aa  290  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  33.5 
 
 		 963 aa  288  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.75 
 
 		 631 aa  286  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  36.21 
 
 		 983 aa  284  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  42.39 
 
 		 453 aa  283  9e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  42.71 
 
 		 926 aa  281  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  41.86 
 
 		 910 aa  280  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  30.91 
 
 		 970 aa  278  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  33.89 
 
 		 1054 aa  278  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  40.76 
 
 		 496 aa  277  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.79 
 
 		 962 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  34.63 
 
 		 928 aa  274  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  42.04 
 
 		 1024 aa  273  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  30.99 
 
 		 967 aa  271  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  41.62 
 
 		 910 aa  268  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  38.14 
 
 		 612 aa  266  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.02 
 
 		 981 aa  264  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  32.11 
 
 		 908 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  37.75 
 
 		 1033 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  32.53 
 
 		 937 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 666 aa  260  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  33.58 
 
 		 1008 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  34.52 
 
 		 989 aa  258  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  41.06 
 
 		 994 aa  258  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  38.68 
 
 		 632 aa  257  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 621 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  32.87 
 
 		 907 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  32.2 
 
 		 993 aa  250  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  39.21 
 
 		 582 aa  248  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 622 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  39.44 
 
 		 915 aa  245  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  33.64 
 
 		 928 aa  245  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  34.85 
 
 		 797 aa  241  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  38.73 
 
 		 1001 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  36.17 
 
 		 1003 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  36.25 
 
 		 1034 aa  237  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  34.52 
 
 		 1036 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  34.78 
 
 		 1030 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 		 850 aa  227  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  33.47 
 
 		 790 aa  224  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6871  hypothetical protein  33.06 
 
 		 854 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  33.88 
 
 		 788 aa  214  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  36.88 
 
 		 1110 aa  213  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 896 aa  211  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  46.9 
 
 		 378 aa  211  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 915 aa  210  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  39.57 
 
 		 761 aa  209  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  34.7 
 
 		 1056 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  35.3 
 
 		 715 aa  209  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  28.91 
 
 		 982 aa  205  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  32.12 
 
 		 1092 aa  200  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  35.26 
 
 		 1058 aa  198  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>