More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3791 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1022 aa  2024    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  43.71 
 
 		 1108 aa  734    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  43.6 
 
 		 954 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  36.46 
 
 		 1021 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  36.39 
 
 		 971 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.33 
 
 		 950 aa  482  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  36.27 
 
 		 1025 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  36.05 
 
 		 992 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  35.41 
 
 		 992 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  35.68 
 
 		 990 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.86 
 
 		 981 aa  446  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  34.55 
 
 		 1003 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  34.8 
 
 		 1020 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  35.68 
 
 		 934 aa  432  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  37.97 
 
 		 775 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.08 
 
 		 996 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  32.99 
 
 		 1014 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.31 
 
 		 921 aa  413  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  31.51 
 
 		 1027 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  39.97 
 
 		 654 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  34.2 
 
 		 913 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  33.7 
 
 		 1025 aa  389  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  33.82 
 
 		 1030 aa  389  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 1319 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  34.44 
 
 		 940 aa  386  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  33.8 
 
 		 931 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  48.98 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.71 
 
 		 1017 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 1048 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.14 
 
 		 964 aa  376  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  33.4 
 
 		 1088 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  40.43 
 
 		 1010 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 1071 aa  365  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  31.99 
 
 		 941 aa  363  7.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  38.4 
 
 		 621 aa  360  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  38.45 
 
 		 1003 aa  359  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  30.65 
 
 		 995 aa  358  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 1346 aa  356  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.64 
 
 		 965 aa  356  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  39.32 
 
 		 1138 aa  354  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  37.82 
 
 		 990 aa  354  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  33 
 
 		 1013 aa  350  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  31.66 
 
 		 993 aa  350  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.72 
 
 		 919 aa  347  8e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  30.81 
 
 		 1022 aa  338  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 921 aa  337  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  33.77 
 
 		 935 aa  332  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  30.58 
 
 		 946 aa  328  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  33.73 
 
 		 1024 aa  325  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  37.14 
 
 		 963 aa  324  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  34.6 
 
 		 910 aa  324  5e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.11 
 
 		 962 aa  324  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  36.88 
 
 		 612 aa  319  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.85 
 
 		 983 aa  318  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  32.26 
 
 		 788 aa  318  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  36.64 
 
 		 1033 aa  317  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  30.53 
 
 		 930 aa  317  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  31.79 
 
 		 965 aa  316  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.04 
 
 		 981 aa  313  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 1003 aa  312  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  37.71 
 
 		 582 aa  310  9e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  31.37 
 
 		 908 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  36.22 
 
 		 666 aa  310  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  38.82 
 
 		 926 aa  308  4.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  30.55 
 
 		 1008 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  31.71 
 
 		 1001 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  33.04 
 
 		 910 aa  306  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  39.84 
 
 		 496 aa  304  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  30.34 
 
 		 907 aa  303  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  32.32 
 
 		 970 aa  302  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  30.74 
 
 		 928 aa  302  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  29.68 
 
 		 1034 aa  298  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  29.99 
 
 		 967 aa  295  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  30.82 
 
 		 1054 aa  294  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  34.31 
 
 		 989 aa  294  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  30.06 
 
 		 993 aa  291  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  35.73 
 
 		 632 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 850 aa  282  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  32.43 
 
 		 790 aa  280  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  31.69 
 
 		 797 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  32.08 
 
 		 978 aa  275  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  29.75 
 
 		 956 aa  274  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  28.14 
 
 		 1030 aa  271  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  37.26 
 
 		 915 aa  271  5.9999999999999995e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.44 
 
 		 631 aa  270  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6871  hypothetical protein  32.08 
 
 		 854 aa  264  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 622 aa  260  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  29 
 
 		 982 aa  258  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  32.66 
 
 		 792 aa  256  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  30.87 
 
 		 915 aa  254  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 621 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  37.62 
 
 		 994 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  33.49 
 
 		 715 aa  249  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  30.11 
 
 		 937 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  37.58 
 
 		 928 aa  247  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 755 aa  241  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  29.29 
 
 		 741 aa  238  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  33.48 
 
 		 1011 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  32.87 
 
 		 680 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  33.49 
 
 		 1004 aa  221  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>