More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5360 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 913 aa  1822    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  33.69 
 
 		 981 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  34.2 
 
 		 1022 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  34.16 
 
 		 996 aa  416  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  34.56 
 
 		 941 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.89 
 
 		 1020 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  34.62 
 
 		 964 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.21 
 
 		 931 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 1025 aa  379  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  34.24 
 
 		 992 aa  365  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  30.91 
 
 		 1027 aa  363  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  33.51 
 
 		 940 aa  362  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  34.72 
 
 		 962 aa  362  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.29 
 
 		 921 aa  355  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  31.51 
 
 		 934 aa  355  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  32.47 
 
 		 992 aa  353  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  29.84 
 
 		 1108 aa  352  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  33.74 
 
 		 1008 aa  346  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 1071 aa  345  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  33.29 
 
 		 990 aa  343  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  36.82 
 
 		 1030 aa  342  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  33.08 
 
 		 1088 aa  342  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  34.73 
 
 		 1014 aa  341  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  32.18 
 
 		 954 aa  338  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  36.67 
 
 		 993 aa  334  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.15 
 
 		 919 aa  330  8e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  33.07 
 
 		 1034 aa  327  7e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  33.03 
 
 		 950 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  33.44 
 
 		 928 aa  320  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  32.01 
 
 		 971 aa  319  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  35.44 
 
 		 915 aa  318  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  29.34 
 
 		 1017 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  30.67 
 
 		 965 aa  311  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  32.44 
 
 		 928 aa  310  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  31.36 
 
 		 1003 aa  308  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  37.11 
 
 		 1010 aa  308  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 1048 aa  308  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  30.99 
 
 		 1021 aa  307  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  29.95 
 
 		 1022 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  34.55 
 
 		 1011 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  38.61 
 
 		 990 aa  305  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  35.04 
 
 		 995 aa  303  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  30.25 
 
 		 907 aa  301  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  37.95 
 
 		 983 aa  300  9e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  30.59 
 
 		 908 aa  300  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  29.97 
 
 		 967 aa  300  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  30.55 
 
 		 921 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  36.24 
 
 		 935 aa  297  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  33.79 
 
 		 1030 aa  296  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  31.17 
 
 		 970 aa  294  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  32.08 
 
 		 1003 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  29.39 
 
 		 930 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  29.94 
 
 		 1013 aa  291  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  29.72 
 
 		 946 aa  290  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  33.42 
 
 		 982 aa  288  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  33.74 
 
 		 788 aa  286  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  30.89 
 
 		 956 aa  284  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  35.26 
 
 		 1033 aa  283  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  31.8 
 
 		 1138 aa  281  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  33.92 
 
 		 775 aa  281  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  36.44 
 
 		 963 aa  281  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 1346 aa  280  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  30.12 
 
 		 1025 aa  279  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  34.28 
 
 		 792 aa  279  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 654 aa  278  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  31.51 
 
 		 1054 aa  277  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  29.11 
 
 		 993 aa  276  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  33.66 
 
 		 621 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  31.95 
 
 		 790 aa  270  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  37.05 
 
 		 926 aa  266  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  35.31 
 
 		 755 aa  265  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  30.43 
 
 		 981 aa  264  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  29.75 
 
 		 965 aa  264  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  38.79 
 
 		 1024 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  33.07 
 
 		 989 aa  261  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 1319 aa  259  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  38.73 
 
 		 1001 aa  260  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 850 aa  257  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  32.01 
 
 		 797 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  30.15 
 
 		 783 aa  247  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  31.14 
 
 		 937 aa  245  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  38.84 
 
 		 453 aa  244  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  31.27 
 
 		 806 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  36.12 
 
 		 910 aa  243  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  35.29 
 
 		 910 aa  241  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  31.65 
 
 		 814 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  33.13 
 
 		 775 aa  236  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  37.07 
 
 		 915 aa  235  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  33.06 
 
 		 612 aa  234  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  31.33 
 
 		 1003 aa  234  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 666 aa  233  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  32.25 
 
 		 1060 aa  231  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  32.79 
 
 		 632 aa  231  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  34.29 
 
 		 1004 aa  230  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  38.65 
 
 		 782 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 621 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  30.61 
 
 		 792 aa  224  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  30.49 
 
 		 715 aa  221  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 770 aa  217  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  31.97 
 
 		 715 aa  217  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>