More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5300 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1017 aa  2036    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  33.57 
 
 		 996 aa  419  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.89 
 
 		 981 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  32.26 
 
 		 1022 aa  389  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  32.94 
 
 		 992 aa  372  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  32.34 
 
 		 931 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  34.44 
 
 		 940 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  31.72 
 
 		 1020 aa  366  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  33.24 
 
 		 963 aa  363  9e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  29.79 
 
 		 1003 aa  355  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  33.83 
 
 		 1088 aa  355  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  31.3 
 
 		 992 aa  354  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.08 
 
 		 964 aa  350  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 1025 aa  347  7e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  36.75 
 
 		 990 aa  346  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  32.04 
 
 		 1022 aa  346  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  32.96 
 
 		 1030 aa  346  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  30.42 
 
 		 1010 aa  343  8e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  32.16 
 
 		 921 aa  343  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  33.21 
 
 		 950 aa  342  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  33.65 
 
 		 954 aa  340  5.9999999999999996e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  31.77 
 
 		 1003 aa  337  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  29.16 
 
 		 1108 aa  336  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 1071 aa  333  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  30.86 
 
 		 946 aa  330  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  31.95 
 
 		 990 aa  327  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  29.61 
 
 		 1027 aa  326  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  30.03 
 
 		 962 aa  324  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  36.84 
 
 		 1138 aa  321  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  30.5 
 
 		 930 aa  320  7.999999999999999e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  30.67 
 
 		 919 aa  318  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  30.54 
 
 		 934 aa  314  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  30.48 
 
 		 1014 aa  313  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  30.78 
 
 		 1033 aa  313  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  35.26 
 
 		 1025 aa  313  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.66 
 
 		 921 aa  312  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  29.76 
 
 		 941 aa  308  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  30.31 
 
 		 1021 aa  308  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  30.79 
 
 		 935 aa  308  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  29.56 
 
 		 913 aa  307  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  32.07 
 
 		 775 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  31.62 
 
 		 989 aa  304  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  29.89 
 
 		 970 aa  304  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 654 aa  300  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  33.39 
 
 		 995 aa  300  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  30.07 
 
 		 1008 aa  300  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  31.28 
 
 		 1013 aa  298  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  29.35 
 
 		 1011 aa  298  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 1048 aa  298  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  28.64 
 
 		 971 aa  290  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  30.66 
 
 		 928 aa  290  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  34.28 
 
 		 621 aa  289  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  32.22 
 
 		 1001 aa  289  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  29.23 
 
 		 1030 aa  287  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  32.99 
 
 		 965 aa  285  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  28.99 
 
 		 908 aa  284  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  29.93 
 
 		 965 aa  283  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  32.12 
 
 		 1054 aa  282  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  29.8 
 
 		 907 aa  280  9e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  29.91 
 
 		 1034 aa  280  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  35.11 
 
 		 632 aa  279  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  30.43 
 
 		 928 aa  276  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  27.97 
 
 		 967 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  35.71 
 
 		 910 aa  263  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  33.73 
 
 		 666 aa  262  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  29.25 
 
 		 993 aa  261  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  31.08 
 
 		 1024 aa  260  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.95 
 
 		 496 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  28.37 
 
 		 937 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  34.28 
 
 		 612 aa  254  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  30.33 
 
 		 788 aa  251  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  28.03 
 
 		 956 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  28.32 
 
 		 981 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  28.47 
 
 		 994 aa  245  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  32.4 
 
 		 983 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  30.48 
 
 		 910 aa  242  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 622 aa  242  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  29.24 
 
 		 1003 aa  240  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  32.58 
 
 		 926 aa  240  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  30.5 
 
 		 806 aa  238  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 1346 aa  234  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 1319 aa  234  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  27.21 
 
 		 982 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.28 
 
 		 631 aa  232  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  27.6 
 
 		 1060 aa  231  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  31.09 
 
 		 775 aa  231  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  37.53 
 
 		 453 aa  231  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  30.57 
 
 		 978 aa  230  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  30.66 
 
 		 783 aa  230  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  27.59 
 
 		 1033 aa  222  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  31.57 
 
 		 850 aa  220  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  28.85 
 
 		 790 aa  219  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  30.09 
 
 		 915 aa  214  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  27.86 
 
 		 1102 aa  213  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  28.74 
 
 		 797 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 621 aa  213  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5351  hypothetical protein  31.25 
 
 		 862 aa  213  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  33.28 
 
 		 582 aa  213  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  29.62 
 
 		 1004 aa  212  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  32.52 
 
 		 915 aa  211  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>