More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7885 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  44.66 
 
 		 1150 aa  683    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  100 
 
 		 1121 aa  2167    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  42.01 
 
 		 1123 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  42.43 
 
 		 1123 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  41.27 
 
 		 1118 aa  555  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  36.6 
 
 		 1090 aa  483  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  39.98 
 
 		 1114 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  39.96 
 
 		 1153 aa  359  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  41.77 
 
 		 1036 aa  356  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  33.28 
 
 		 1132 aa  317  7e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  42.5 
 
 		 1161 aa  310  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  32.13 
 
 		 1071 aa  275  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 1141 aa  253  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 1141 aa  250  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 1141 aa  250  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  34.56 
 
 		 1141 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  32.75 
 
 		 1148 aa  234  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  32.13 
 
 		 1118 aa  233  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  52.63 
 
 		 489 aa  226  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  52.67 
 
 		 655 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  43.77 
 
 		 969 aa  211  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  53.04 
 
 		 676 aa  200  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  32.45 
 
 		 723 aa  196  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  33.83 
 
 		 1146 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  31.51 
 
 		 1193 aa  177  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 1151 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  36.83 
 
 		 1733 aa  170  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  40.47 
 
 		 1000 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  47.93 
 
 		 611 aa  163  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  28.72 
 
 		 1029 aa  161  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 1190 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.03 
 
 		 981 aa  159  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  39 
 
 		 1125 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  36.81 
 
 		 1100 aa  155  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  37.3 
 
 		 931 aa  153  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 654 aa  153  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  37.87 
 
 		 965 aa  152  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  39.32 
 
 		 1102 aa  152  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  37.41 
 
 		 1003 aa  152  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 621 aa  152  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.96 
 
 		 940 aa  151  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 268 aa  151  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  35.51 
 
 		 934 aa  150  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  39.02 
 
 		 1092 aa  150  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  39.8 
 
 		 1103 aa  149  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 1005 aa  148  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 628 aa  147  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  40 
 
 		 1055 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  33.4 
 
 		 1054 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  38.82 
 
 		 957 aa  144  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  37.42 
 
 		 1030 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.38 
 
 		 1017 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  40.41 
 
 		 647 aa  142  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  40.98 
 
 		 1339 aa  141  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  35.69 
 
 		 1093 aa  141  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.44 
 
 		 1029 aa  140  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  35.83 
 
 		 990 aa  140  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  40.06 
 
 		 1186 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  37.12 
 
 		 1088 aa  140  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  30.99 
 
 		 621 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  33.63 
 
 		 1699 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  36.68 
 
 		 1014 aa  138  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.39 
 
 		 1097 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  38.8 
 
 		 926 aa  136  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.76 
 
 		 1110 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.11 
 
 		 1034 aa  136  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1022 aa  136  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  38.4 
 
 		 388 aa  135  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  38.4 
 
 		 833 aa  135  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.14 
 
 		 496 aa  135  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.92 
 
 		 1108 aa  135  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  33.15 
 
 		 1158 aa  134  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  31.41 
 
 		 1003 aa  134  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  34.06 
 
 		 943 aa  133  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  32.98 
 
 		 1022 aa  132  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  33.24 
 
 		 1051 aa  132  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  36.25 
 
 		 913 aa  132  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  28.23 
 
 		 1010 aa  132  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  32.23 
 
 		 930 aa  132  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  37.46 
 
 		 950 aa  131  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 973 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.76 
 
 		 1017 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 1071 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  33.61 
 
 		 1022 aa  130  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  39.14 
 
 		 1036 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  36.22 
 
 		 907 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  39.66 
 
 		 262 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33.07 
 
 		 990 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  35.69 
 
 		 1054 aa  129  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  36.6 
 
 		 1018 aa  128  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.62 
 
 		 996 aa  128  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  35.45 
 
 		 921 aa  127  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  34.17 
 
 		 937 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  34.46 
 
 		 983 aa  127  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  37.2 
 
 		 378 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.71 
 
 		 1067 aa  127  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.5 
 
 		 1055 aa  126  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  34.08 
 
 		 630 aa  125  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.75 
 
 		 921 aa  125  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 963 aa  125  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>