More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4854 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 786 aa  1548    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2453  hypothetical protein  94.88 
 
 		 245 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680922  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  35.22 
 
 		 1146 aa  327  7e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 1151 aa  261  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  45.97 
 
 		 1339 aa  180  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  45.58 
 
 		 668 aa  165  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  39.81 
 
 		 965 aa  135  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  38.64 
 
 		 1003 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  38.21 
 
 		 1123 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  35 
 
 		 990 aa  121  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  26.99 
 
 		 1114 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  28.16 
 
 		 1071 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  37.14 
 
 		 1004 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  37.44 
 
 		 1033 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  28.79 
 
 		 1022 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  41.31 
 
 		 1058 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  27.88 
 
 		 1121 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  37.21 
 
 		 1000 aa  107  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  35.19 
 
 		 1014 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  36.97 
 
 		 1021 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  36.45 
 
 		 957 aa  106  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  26.76 
 
 		 1733 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  31.99 
 
 		 940 aa  104  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  34.3 
 
 		 453 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.75 
 
 		 496 aa  103  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  39.44 
 
 		 1100 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 268 aa  103  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  27.12 
 
 		 983 aa  102  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  35.07 
 
 		 1054 aa  102  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 489 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  32.2 
 
 		 1034 aa  101  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  37.02 
 
 		 950 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  36.54 
 
 		 1011 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  35.55 
 
 		 1025 aa  99  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  33.02 
 
 		 969 aa  98.6  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  37.09 
 
 		 1186 aa  97.4  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 282 aa  97.4  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  38.86 
 
 		 963 aa  97.8  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  26.39 
 
 		 1090 aa  97.4  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 1319 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 622 aa  97.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  31.72 
 
 		 1058 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  30.81 
 
 		 1010 aa  97.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  36.62 
 
 		 1048 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  27.8 
 
 		 1132 aa  96.3  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 602 aa  96.3  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  37.09 
 
 		 676 aa  95.5  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  32.85 
 
 		 1013 aa  95.9  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  27.95 
 
 		 1036 aa  95.9  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  37.76 
 
 		 1056 aa  95.5  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  37.22 
 
 		 978 aa  95.1  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 981 aa  94.7  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  25.66 
 
 		 723 aa  94.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.64 
 
 		 1020 aa  94  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.42 
 
 		 931 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 		 1005 aa  93.6  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  29.41 
 
 		 621 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 654 aa  93.2  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 1161 aa  92.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.28 
 
 		 1110 aa  91.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  34.58 
 
 		 597 aa  91.7  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  32.05 
 
 		 1092 aa  91.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  32.21 
 
 		 535 aa  91.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  35.41 
 
 		 655 aa  91.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5104  transcriptional regulator, SARP family  34.53 
 
 		 994 aa  91.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 292 aa  91.3  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  29.62 
 
 		 1030 aa  90.9  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  28.84 
 
 		 981 aa  90.9  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  35.07 
 
 		 1043 aa  90.5  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.96 
 
 		 921 aa  90.1  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  32.73 
 
 		 378 aa  90.1  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  28.64 
 
 		 967 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  26 
 
 		 996 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  30.7 
 
 		 990 aa  89  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  30.19 
 
 		 267 aa  89.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  33.96 
 
 		 1093 aa  88.6  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  32.51 
 
 		 1036 aa  87.8  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 621 aa  87.8  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  34.93 
 
 		 1018 aa  87.8  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 1346 aa  87.8  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  26.98 
 
 		 946 aa  87.8  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  27.73 
 
 		 1003 aa  87  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  29.95 
 
 		 995 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  35.35 
 
 		 775 aa  87  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  27.76 
 
 		 964 aa  87  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  32.08 
 
 		 833 aa  87  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  32.69 
 
 		 1097 aa  86.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  30.13 
 
 		 262 aa  86.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  27.96 
 
 		 1027 aa  86.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  31.02 
 
 		 252 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  29.94 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.89 
 
 		 1102 aa  85.5  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  32.72 
 
 		 647 aa  84.7  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  30.59 
 
 		 1003 aa  84.3  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.09 
 
 		 921 aa  84.3  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  29.23 
 
 		 962 aa  83.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  34.29 
 
 		 1055 aa  84  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.72 
 
 		 919 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2444  SARP family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 259 aa  84  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>