238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5257 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 655 aa  1227    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  68.75 
 
 		 676 aa  657    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  58.05 
 
 		 628 aa  514  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  47.3 
 
 		 647 aa  465  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  46.52 
 
 		 611 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  58.44 
 
 		 1153 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  56.55 
 
 		 489 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  43.78 
 
 		 1036 aa  248  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  55 
 
 		 1123 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  54.55 
 
 		 1118 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  57.14 
 
 		 1123 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  52.67 
 
 		 1121 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  50.59 
 
 		 1114 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  51.05 
 
 		 1090 aa  198  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  55.51 
 
 		 1150 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 969 aa  189  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  45.95 
 
 		 1339 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  45.28 
 
 		 1733 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  41.73 
 
 		 1000 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  41.04 
 
 		 981 aa  150  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  43.98 
 
 		 1132 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  43.9 
 
 		 1055 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  44.72 
 
 		 965 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  46.02 
 
 		 1161 aa  148  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  42.75 
 
 		 1102 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 1005 aa  141  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  40.33 
 
 		 1017 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  40.12 
 
 		 1125 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  38.64 
 
 		 934 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  43.27 
 
 		 1030 aa  138  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 268 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  41.7 
 
 		 950 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  39.92 
 
 		 921 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  40.49 
 
 		 1003 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  42.75 
 
 		 1103 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.47 
 
 		 957 aa  135  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  41.43 
 
 		 940 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  40.24 
 
 		 1092 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  39.92 
 
 		 1018 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  39.6 
 
 		 833 aa  133  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  41.7 
 
 		 992 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  40.49 
 
 		 378 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 621 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  41.77 
 
 		 1699 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 1158 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  40.2 
 
 		 1100 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  39.51 
 
 		 931 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  44.18 
 
 		 926 aa  128  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  38.37 
 
 		 1108 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 654 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  40.71 
 
 		 935 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  36.76 
 
 		 1022 aa  123  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  40.47 
 
 		 1071 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  38.08 
 
 		 1088 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  35.86 
 
 		 388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  40.74 
 
 		 963 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  37.75 
 
 		 1013 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 968 aa  122  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  44.73 
 
 		 1146 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  38.21 
 
 		 1010 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  37.3 
 
 		 597 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  37.02 
 
 		 996 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 1151 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 1227 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  37.9 
 
 		 919 aa  117  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 276 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  37.9 
 
 		 1011 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 1319 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.7 
 
 		 496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  36.48 
 
 		 453 aa  114  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 1071 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  41.06 
 
 		 1036 aa  114  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  38 
 
 		 943 aa  114  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  37.86 
 
 		 1017 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 979 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  37.31 
 
 		 1097 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  40.41 
 
 		 915 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  40.55 
 
 		 668 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  37.11 
 
 		 990 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  37.8 
 
 		 1004 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 1093 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  38.56 
 
 		 385 aa  111  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  38.31 
 
 		 989 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 602 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  37.45 
 
 		 1054 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4451  transcriptional regulator, SARP family  36.63 
 
 		 266 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  39.43 
 
 		 1058 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  36.18 
 
 		 379 aa  108  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 297 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.79 
 
 		 960 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  35.83 
 
 		 1021 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  39.68 
 
 		 1066 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  37.86 
 
 		 1003 aa  108  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  41.37 
 
 		 1025 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  40.16 
 
 		 910 aa  107  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  32 
 
 		 622 aa  106  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  32.95 
 
 		 621 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  36.9 
 
 		 1022 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  38.51 
 
 		 1186 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  36.8 
 
 		 990 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>