284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2592 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  85.38 
 
 		 597 aa  946    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 602 aa  1175    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4209  transcriptional regulator, SARP family  52.24 
 
 		 271 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3688  transcriptional regulator, SARP family  53.06 
 
 		 348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1071 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  35.47 
 
 		 1088 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  32.42 
 
 		 1022 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  33.79 
 
 		 931 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.36 
 
 		 921 aa  188  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 1025 aa  188  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  32.34 
 
 		 989 aa  186  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  33.55 
 
 		 940 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.44 
 
 		 631 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.95 
 
 		 950 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 654 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.3 
 
 		 981 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  30.41 
 
 		 934 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  30.99 
 
 		 921 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  29.28 
 
 		 990 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 622 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  29.83 
 
 		 990 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  30.36 
 
 		 1030 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  30.91 
 
 		 1003 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  30.56 
 
 		 956 aa  160  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  32.9 
 
 		 1092 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  32.17 
 
 		 910 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  30.33 
 
 		 946 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 928 aa  157  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  34.73 
 
 		 915 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  30.95 
 
 		 930 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  29.96 
 
 		 1014 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  30.95 
 
 		 919 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  28.87 
 
 		 612 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  29.44 
 
 		 1022 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  31.92 
 
 		 926 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  31.6 
 
 		 992 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  30.99 
 
 		 995 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  30.95 
 
 		 1033 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  30.76 
 
 		 1010 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  29.12 
 
 		 971 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.02 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.75 
 
 		 996 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  32.74 
 
 		 1102 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  30.35 
 
 		 910 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 378 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  31.01 
 
 		 963 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  29.28 
 
 		 1001 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  28.84 
 
 		 992 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  33.24 
 
 		 453 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  33.61 
 
 		 1017 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  30.28 
 
 		 775 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  28.79 
 
 		 1017 aa  138  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  30.55 
 
 		 1054 aa  138  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  29.23 
 
 		 621 aa  136  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  31.51 
 
 		 957 aa  136  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.13 
 
 		 981 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 1103 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 1093 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  28.08 
 
 		 1021 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  28.32 
 
 		 964 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  30.3 
 
 		 1025 aa  135  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  30.75 
 
 		 1030 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  26.62 
 
 		 1027 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 621 aa  134  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  31.57 
 
 		 1138 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 952 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  31.62 
 
 		 1055 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  34.01 
 
 		 1186 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  35.51 
 
 		 1108 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  29.19 
 
 		 967 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  30.98 
 
 		 994 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  32.5 
 
 		 1125 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  33.43 
 
 		 1000 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  36.31 
 
 		 1733 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  31.29 
 
 		 1042 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  36.06 
 
 		 960 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  28.3 
 
 		 983 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  34.07 
 
 		 919 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  29.98 
 
 		 935 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  28.05 
 
 		 913 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  29.4 
 
 		 907 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  30.7 
 
 		 954 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  38.24 
 
 		 1058 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  28.94 
 
 		 1003 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  34.02 
 
 		 1123 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 1319 aa  123  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  33.44 
 
 		 1072 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  32.11 
 
 		 1058 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  31.95 
 
 		 1024 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  30.75 
 
 		 908 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 1158 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 		 1005 aa  120  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  27.96 
 
 		 1008 aa  120  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  31.06 
 
 		 965 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 1048 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  29.67 
 
 		 1003 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 968 aa  117  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  32.74 
 
 		 370 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  31.31 
 
 		 833 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  29.96 
 
 		 1020 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>