More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6166 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1036 aa  1978    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  39.13 
 
 		 1123 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  40.59 
 
 		 1123 aa  525  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  34.64 
 
 		 1118 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  36.76 
 
 		 1090 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  34.79 
 
 		 1150 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  46.97 
 
 		 1153 aa  389  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  34.97 
 
 		 1121 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  33.6 
 
 		 1114 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  34.99 
 
 		 1132 aa  272  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  44.05 
 
 		 655 aa  252  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 1161 aa  229  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  32.77 
 
 		 1071 aa  224  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  55.6 
 
 		 676 aa  215  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  47.6 
 
 		 489 aa  214  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 1118 aa  205  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.96 
 
 		 1141 aa  193  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 969 aa  191  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  30.82 
 
 		 1148 aa  184  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 1141 aa  180  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 1141 aa  180  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 1141 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  39.88 
 
 		 1733 aa  178  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 1198 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  33.23 
 
 		 1146 aa  172  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 723 aa  171  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  48.97 
 
 		 611 aa  169  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 628 aa  167  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  35.31 
 
 		 981 aa  163  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  37.2 
 
 		 1030 aa  158  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  43.9 
 
 		 1339 aa  158  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  37.63 
 
 		 647 aa  157  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.48 
 
 		 957 aa  155  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 1071 aa  150  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  35.14 
 
 		 940 aa  150  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  36.45 
 
 		 965 aa  147  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  36.23 
 
 		 1000 aa  145  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  40.72 
 
 		 1092 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 1100 aa  143  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  39.62 
 
 		 1017 aa  141  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  36.31 
 
 		 1003 aa  141  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  34.88 
 
 		 1010 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  39.2 
 
 		 926 aa  139  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  39.31 
 
 		 1055 aa  137  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  37.1 
 
 		 1699 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 276 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 1151 aa  135  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  33.17 
 
 		 992 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  38.74 
 
 		 1125 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.53 
 
 		 1193 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.8 
 
 		 1102 aa  131  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  31.02 
 
 		 668 aa  131  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.92 
 
 		 950 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  36.59 
 
 		 931 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  33.23 
 
 		 1017 aa  128  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  34.97 
 
 		 378 aa  128  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  33.09 
 
 		 981 aa  127  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  35.31 
 
 		 990 aa  127  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  36.16 
 
 		 833 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 934 aa  126  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  27.72 
 
 		 1029 aa  125  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  37.04 
 
 		 963 aa  124  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  32.72 
 
 		 1022 aa  124  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 1066 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 1005 aa  124  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  29.02 
 
 		 1054 aa  122  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  35.6 
 
 		 388 aa  122  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 		 990 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  36.5 
 
 		 1058 aa  122  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 1108 aa  121  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  26.81 
 
 		 1190 aa  121  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 		 1093 aa  120  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  38.43 
 
 		 1158 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.36 
 
 		 1103 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  33.54 
 
 		 1022 aa  120  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 915 aa  120  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 268 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  34.4 
 
 		 278 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 921 aa  120  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  34.94 
 
 		 1014 aa  120  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  34.11 
 
 		 379 aa  119  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  33.14 
 
 		 1027 aa  118  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  38.21 
 
 		 453 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  34.8 
 
 		 297 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  32.32 
 
 		 983 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  33.9 
 
 		 1097 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  34.89 
 
 		 1186 aa  116  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  34.28 
 
 		 943 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  37.4 
 
 		 935 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  36.15 
 
 		 1013 aa  115  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  36.29 
 
 		 1004 aa  115  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 654 aa  115  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 979 aa  115  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 952 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  33.23 
 
 		 1018 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  36.22 
 
 		 1025 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  31.93 
 
 		 1088 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  35.86 
 
 		 919 aa  112  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.08 
 
 		 996 aa  111  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  36.64 
 
 		 954 aa  111  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>